RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434030.1

SEMA3B-205, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA3B, Length 1,011 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-205ENST00000434030 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa21.63■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 GLIS1Q8NBF1 620 aa21.63■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 HM13Q8TCT9 377 aa21.63■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21.63■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.63■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 CCDC78A2IDD5 438 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 SLC35G4P0C7Q5 338 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 PPP1CAP62136 330 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 SH3BP2P78314 561 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 FOXM1Q08050 763 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 C19orf57Q0VDD7 668 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 LY6DQ14210 128 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 PLCL1Q15111 1095 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 CCNG2Q16589 344 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 SKIDA1Q1XH10 827 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 CCDC38Q502W7 563 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 KLHL35Q6PF15 583 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 CCM2Q9BSQ5 444 aa21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 COL6A6A6NMZ7 2263 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 E7EVH7 732 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 STK17BO94768 372 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 GRIA1P42261 906 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 LMAN1P49257 510 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 SEMA5AQ13591 1074 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 GSE1Q14687 1217 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 DBN1Q16643 649 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 NLGN4XQ8N0W4 816 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 CLDN19Q8N6F1 224 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 TLR10Q9BXR5 811 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 SEMA4CQ9C0C4 833 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 SEMA5BQ9P283 1151 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 PAK5Q9P286 719 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 FASNP49327 2511 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 OR51F1A6NGY5 319 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 KALRNO60229 2985 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 GAS8O95995 478 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 LIFP15018 202 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 LINC00303Q3SY05 128 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 ZNF843Q8N446 348 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 CCDC89Q8N998 374 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 TRIM58Q8NG06 486 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 OR6C1Q96RD1 312 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 COG4Q9H9E3 785 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa21.6■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 HEATR9A2RTY3 570 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 CCDC162PA2VCL2 907 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 OR5K3A6NET4 321 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 DLGAP3O95886 979 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 FOXN2P32314 431 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 RPL22P35268 128 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 CYP4F2P78329 520 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 IL11RAQ14626 422 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 OR13J1Q8NGT2 312 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 UBXN4Q92575 508 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 RANBP9Q96S59 729 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 MAP3K3Q99759 626 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 SLC12A9Q9BXP2 914 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 OR52A5Q9H2C5 316 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 VPS37BQ9H9H4 285 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 CASS4Q9NQ75 786 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 HRASLS2Q9NWW9 162 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 RIMKLBQ9ULI2 386 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa21.59■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 FGGP02679 453 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 ITGB2P05107 769 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 APRTP07741 180 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 ADRA1DP25100 572 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 PDHA2P29803 388 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 LAMB3Q13751 1172 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 TSTD2Q5T7W7 516 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 EXTL1Q92935 676 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 HDAC10Q969S8 669 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 SLC41A2Q96JW4 573 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 ZNF778Q96MU6 729 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 PRSS21Q9Y6M0 314 aa21.58■■□□□ 1.05
SEMA3B-205ENST00000434030 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa21.57■■□□□ 1.04
SEMA3B-205ENST00000434030 OR6C74A6NCV1 312 aa21.57■■□□□ 1.04
SEMA3B-205ENST00000434030 AP2A2O94973 939 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms