RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 AOAHP28039 575 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 MMP12P39900 470 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 STX5Q13190 355 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 MAPRE2Q15555 327 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 LAYNQ6UX15 382 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 OR4F6Q8NGB9 312 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 METTL6Q8TCB7 284 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 RHBDF1Q96CC6 855 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 LINC01565O15544 149 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 HTR6P50406 440 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 CEACAM7Q14002 265 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ACOX1Q15067 660 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 CRY1Q16526 586 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 DPPA4Q7L190 304 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 MRGBPQ9NV56 204 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 KRT87PA6NCN2 255 aa22.78■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 FCARP24071 287 aa22.78■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 GRM2Q14416 872 aa22.78■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf50Q9BV19 199 aa22.78■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 DKK3Q9UBP4 350 aa22.78■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.78■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 NR5A2O00482 541 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 BAG2O95816 211 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ATP4BP51164 291 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 XKR7Q5GH72 579 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PIGGQ5H8A4 983 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ERAP2Q6P179 960 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 LIPIQ6XZB0 460 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 MIER2Q8N344 545 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 FAM156AQ8NDB6 213 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 SMOXQ9NWM0 555 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ANPEPP15144 967 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 NFKBIAP25963 317 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 DCDC1P59894 354 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 RPS6KA2Q15349 733 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINI1Q99574 410 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 SLC25A23Q9BV35 468 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 CD244Q9BZW8 370 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ADA2Q9NZK5 511 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 OPTCQ9UBM4 332 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PLXNA2O75051 1894 aa22.77■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 CBSLP0DN79 551 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 CBSP35520 551 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PIK3CGP48736 1102 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 CCNG1P51959 295 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 AP2B1P63010 937 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TRAF3Q13114 568 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 LRP8Q14114 963 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF284Q2VY69 593 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SULT1C3Q6IMI6 304 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 VITQ6UXI7 678 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TRAM1L1Q8N609 369 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 NDE1Q9NXR1 346 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ARL15Q9NXU5 204 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 MRASO14807 208 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 INPP4BO15327 924 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SPINT1O43278 529 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SGTAO43765 313 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 NRP2O60462 931 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 MSH3P20585 1137 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 RPIAP49247 311 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ACADVLP49748 655 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PSME3P61289 254 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF234Q14588 700 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 IL27RAQ6UWB1 636 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ELMO1Q92556 727 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 AP2M1Q96CW1 435 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SLC39A3Q9BRY0 314 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 GDE1Q9NZC3 331 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PDE10AQ9Y233 779 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D3BA6NDS4 549 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM202A6NGA9 273 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 CFAP99D6REC4 459 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 VPS4BO75351 444 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 OTCP00480 354 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PRNPP04156 253 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PRR35P0CG20 571 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 VPS26BQ4G0F5 336 aa22.75■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms