RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LONRF2Q1L5Z9 754 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ODF2Q5BJF6 829 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FNBP1LQ5T0N5 605 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARMC6Q6NXE6 501 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LUZP1Q86V48 1076 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSELQ8IZU8 1212 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A41Q8N5S1 370 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFPM2Q8WW38 1151 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRGPRX2Q96LB1 330 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WWP1Q9H0M0 922 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FANCEQ9HB96 536 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKP3Q9Y446 797 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO9AB2RTY4 2548 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6C74A6NCV1 312 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MGAT4DA6NG13 374 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEN1O00255 615 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BUD23O43709 281 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPM1O60762 260 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-DPA1P20036 260 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSH3P20585 1137 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP25P42331 645 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR2C2P49116 596 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABRQ12979 859 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC38Q5VT99 294 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFSD7Q6UXD7 560 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DET1Q7L5Y6 550 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPS6Q86YV9 775 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8NA96 180 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FDCSPQ8NFU4 85 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35G2Q8TBE7 412 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPT1BQ92523 772 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPM1MQ96MI6 270 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDT9Q9BW91 350 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TLR10Q9BXR5 811 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC29A3Q9BZD2 475 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEF6Q9H4E7 631 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LUZP4Q9P127 313 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCFL5Q9UL49 500 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSL5Q9ULC5 683 aa12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL33A6NCF5 533 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F5H423 210 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF1O95521 474 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35G4P0C7Q5 338 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RORAP35398 523 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VAV2P52735 878 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKAA1Q13131 559 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC1A5Q15758 541 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCN10Q6JVE6 187 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM198BQ6UWH4 519 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOT2Q8IXI1 618 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOT1Q8IXI2 618 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IPMKQ8NFU5 416 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2L2Q8NH16 312 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLIP3Q96DZ5 547 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RMDN2Q96LZ7 410 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCRL5Q96RD9 977 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLNQ9BYT8 704 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLAMF7Q9NQ25 335 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM8A1Q9UBU6 413 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POMT2Q9UKY4 750 aa12.82□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A1L4Q6 167 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCP11X1B4DZS4 312 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STX7O15400 261 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNNT1P13805 278 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH3P22223 829 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFS1P28331 727 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPP3Q13368 585 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFDP2Q14188 446 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCL7AQ4VC05 210 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM69BQ5VUD6 431 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC6A19Q695T7 634 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYTL1Q8IYJ3 562 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF567Q8N184 647 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF398Q8TD17 642 aa12.81□□□□□ -0.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAT14Q8WUY8 206 aa12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms