RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 ACVRL1P37023 503 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ARL10Q8N8L6 244 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LCN9Q8WX39 176 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS14P62263 151 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 HERVK_113P63132 956 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LGALS3BPQ08380 585 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RGS21Q2M5E4 152 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 NEK5Q6P3R8 708 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM156AQ8NDB6 213 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 OR10A6Q8NH74 314 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ERVK-6Q9BXR3 956 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RASSF1Q9NS23 344 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 K7EPI3 171 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CAPN15O75808 1086 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT1A6P19224 532 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT1A1P22309 533 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT1A4P22310 534 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT1A3P35503 534 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT1A5P35504 534 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFAF6Q330K2 333 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TXNDC8Q6A555 127 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CBR4Q8N4T8 237 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB26Q9ULW5 256 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC72A6NJI9 287 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC31A1O15431 190 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SEC13P55735 322 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 THAP5Q7Z6K1 395 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC9A6Q92581 669 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 OSER1Q9NX31 292 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PRKCGP05129 697 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ITPKBP27987 946 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 GPX6P59796 221 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ECT2LQ008S8 904 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 C6orf52Q5T4I8 152 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 BORCS6Q96GS4 357 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SSR3Q9UNL2 185 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TNFRSF11BO00300 401 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 IFNW1P05000 195 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 THRBP10828 461 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC13A3Q8WWT9 602 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TEX264Q9Y6I9 313 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TMC5Q6UXY8 1006 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2AG1Q9H205 316 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 POMPQ9Y244 141 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A2O15244 555 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 KERAO60938 352 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ETS2P15036 469 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TAF8Q7Z7C8 310 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB46Q86UZ6 589 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCB10Q9NRK6 738 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGEB17A8MXT2 336 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 BCKDKO14874 412 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 TULP3O75386 442 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 GALNT2Q10471 571 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 MZT2BQ6NZ67 158 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM180AQ6UWF9 173 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LMO3Q8TAP4 145 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR88Q9GZN0 384 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 PI15O43692 258 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ALPIP09923 528 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 NT5EP21589 574 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC34A3Q8N130 599 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LRTOMTQ8WZ04 291 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 RACGAP1Q9H0H5 632 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 FANCEQ9HB96 536 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 DMTF1Q9Y222 760 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR17Q13304 367 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 HEPACAMQ14CZ8 416 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB6Q15916 424 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFA9Q16795 377 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 MSS51Q4VC12 460 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF730Q6ZMV8 503 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LMLNQ96KR4 655 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 ERN1O75460 977 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 LAMP2P13473 410 aa21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.6 ms