RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.4■□□□□ 0.86
C4orf48-201ENST00000409248 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.4■□□□□ 0.86
C4orf48-201ENST00000409248 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.4■□□□□ 0.86
C4orf48-201ENST00000409248 UNC5BQ8IZJ1 945 aa20.4■□□□□ 0.86
C4orf48-201ENST00000409248 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
C4orf48-201ENST00000409248 TCF12Q99081 682 aa20.4■□□□□ 0.86
C4orf48-201ENST00000409248 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.4■□□□□ 0.86
C4orf48-201ENST00000409248 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
C4orf48-201ENST00000409248 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.4■□□□□ 0.86
C4orf48-201ENST00000409248 BPTFQ12830 3046 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 D6RAR5 112 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 NDUFS3O75489 264 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 EML2O95834 649 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CCL7P80098 99 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 HHEXQ03014 270 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CAMK2BQ13554 666 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CDKL2Q92772 493 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SH3KBP1Q96B97 665 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ZFATQ9P243 1243 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 RAB21Q9UL25 225 aa20.39■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SPEGQ15772 3267 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 KNTC1P50748 2209 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PRR19A6NJB7 356 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 C1QTNF9P0C862 333 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 HALP42357 657 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 NSG1P42857 185 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SLC1A2P43004 574 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PRLHRP49683 370 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PMS2P54278 862 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ISXQ2M1V0 245 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 MAP9Q49MG5 647 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PACS1Q6VY07 963 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CYS1Q717R9 158 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CNTN4Q8IWV2 1026 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SGF29Q96ES7 293 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 SLC38A3Q99624 504 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 WASH6PQ9NQA3 447 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ACACBO00763 2458 aa20.38■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 A0A1W2PQM1 296 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 MGAT4DA6NG13 374 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 F8W8V4 182 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ACSL3O95573 720 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PROS1P07225 676 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ALDH4A1P30038 563 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 B4GALNT1Q00973 533 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 EMBQ6PCB8 327 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 KIAA0408Q6ZU52 694 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 DENND6AQ8IWF6 608 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM74Q96NL1 305 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.37■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 QSOX1O00391 747 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 PPM1DO15297 605 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 AP2A2O94973 939 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 GPLD1P80108 840 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 CTBP1Q13363 440 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC6Q86X45 466 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 OR2L2Q8NH16 312 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 OR10G6Q8NH81 332 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 HM13Q8TCT9 377 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 FBF1Q8TES7 1133 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.36■□□□□ 0.85
C4orf48-201ENST00000409248 STRADBQ9C0K7 418 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms