RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM151BQ8IW70 566 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 BTBD6Q96KE9 485 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 TTC25Q96NG3 672 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 IP6K3Q96PC2 410 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 HAUS4Q9H6D7 363 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 COPG2Q9UBF2 871 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 SLC24A2Q9UI40 661 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 PADI2Q9Y2J8 665 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 HIVEP1P15822 2718 aa18.74■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 ZGRF1Q86YA3 2104 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 KCNK1O00180 336 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 PEX12O00623 359 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF749O43361 778 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL41O60662 606 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 GZMAP12544 262 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 AGXTP21549 392 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 HADHAP40939 763 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 PREPP48147 710 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 SOX8P57073 446 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 FOXL2P58012 376 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 GBE1Q04446 702 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB17Q13105 803 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 DPYSL3Q14195 570 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 HIF1AQ16665 826 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM220Q6QAJ8 160 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 BRSK1Q8TDC3 778 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 C12orf66Q96MD2 445 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 DHRS4Q9BTZ2 278 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 WWP1Q9H0M0 922 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 C1GALT1Q9NS00 363 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 P4HTMQ9NXG6 502 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 POMT2Q9UKY4 750 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 SPO11Q9Y5K1 396 aa18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 STSP08842 583 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 CBSLP0DN79 551 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 ST6GAL1P15907 406 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 CBSP35520 551 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 LMAN1P49257 510 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 PCSK7Q16549 785 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC183Q5T5S1 534 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 METRNLQ641Q3 311 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 CCNYQ8ND76 341 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 OR4E2Q8NGC2 313 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 FAR1Q8WVX9 515 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 SERTAD3Q9UJW9 196 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 SEC16AO15027 2179 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 FER1L5A0AVI2 2057 aa18.72■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GUH1 482 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 OR2AG2A6NM03 316 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 E7EQ34 232 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 GPR39O43194 453 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 UGT1A9O60656 530 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 UGT1A6P19224 532 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 UGT1A1P22309 533 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 UGT1A4P22310 534 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 GDF7Q7Z4P5 450 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 ZFPM2Q8WW38 1151 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 HDAC11Q96DB2 347 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 CEP41Q9BYV8 373 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 KLHL25Q9H0H3 589 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 UGT1A7Q9HAW7 530 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 UGT1A10Q9HAW8 530 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 UGT1A8Q9HAW9 530 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC53A6NM62 1247 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 IGHEP01854 428 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 MSL3P1P0C860 447 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 FOLR3P41439 243 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 TSFMP43897 325 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PRKAA1Q13131 559 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 ART3Q13508 389 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf189Q5VU69 101 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NIPA2Q8N8Q9 360 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJB14Q8TBM8 379 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 PPP4R1Q8TF05 950 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 NRTNQ99748 197 aa18.7■□□□□ 0.58
HOXD12-201ENST00000404162 IL26Q9NPH9 171 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms