RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392991.8

OLFM1-208, Transcript of olfactomedin 1, human

TSL 2 BASIC

Gene OLFM1, Length 1,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OLFM1-208	ENST00000392991	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	SMAP	O00193	183 aa		31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	PDHA2	P29803	388 aa		31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	BBS9	Q3SYG4	887 aa		31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	NEPRO	Q6NW34	567 aa		31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	ERP44	Q9BS26	406 aa		31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	OGFR	Q9NZT2	677 aa		31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		31.1	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	DUX1	O43812	170 aa		31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	NDUFS3	O75489	264 aa		31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	PGAM1	P18669	254 aa		31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	CYP4F3	Q08477	520 aa		31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	RPA4	Q13156	261 aa		31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	ELMO1	Q92556	727 aa		31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	IQCF5	A8MTL0	148 aa		31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	MPO	P05164	745 aa		31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	ITGB6	P18564	788 aa		31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	MAPK9	P45984	424 aa		31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	CENPU	Q71F23	418 aa		31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	LPGAT1	Q92604	370 aa		31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	SATB2	Q9UPW6	733 aa		31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		31.08	■■■□□ 2.57
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	TUBB4A	P04350	444 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	LIMK2	P53671	638 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	GABRE	P78334	506 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	CRYM	Q14894	314 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	LONRF1	Q17RB8	773 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	PDIK1L	Q8N165	341 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	TCF12	Q99081	682 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	DPH5	Q9H2P9	285 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	DKK4	Q9UBT3	224 aa		31.07	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991		F8W8V4	182 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	MPST	P25325	297 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	CCR7	P32248	378 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	LSS	P48449	732 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	BRD3	Q15059	726 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	HIF1A	Q16665	826 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	PHF19	Q5T6S3	580 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	DUPD1	Q68J44	220 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	LRRC6	Q86X45	466 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	KRT222	Q8N1A0	295 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	CARD6	Q9BX69	1037 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	STRADB	Q9C0K7	418 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	AK5	Q9Y6K8	562 aa		31.06	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	BRINP1	O60477	761 aa		31.05	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	UBXN7	O94888	489 aa		31.05	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	THRA	P10827	490 aa		31.05	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	TYRP1	P17643	537 aa		31.05	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
OLFM1-208	ENST00000392991	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms