RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PP18 115 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 J3QRK9 145 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TAF4O00268 1085 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NME4O00746 187 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 DCLK1O15075 740 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 INPP4BO15327 924 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ASNA1O43681 348 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NUAK1O60285 661 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RFPL3O75679 317 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GABARAPO95166 117 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CD4P01730 458 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CHRNA1P02708 482 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 RAP2AP10114 183 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 THRBP10828 461 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CDH1P12830 882 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CYP3A5P20815 502 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MATN1P21941 496 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GPX3P22352 226 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TGM1P22735 817 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CRHBPP24387 322 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 OPRL1P41146 370 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PLA2G16P53816 162 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ARSFP54793 590 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 KCNK10P57789 538 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TUBA1BP68363 451 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 DAG1Q14118 895 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CES3Q6UWW8 571 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TUBA1AQ71U36 451 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ITIH5Q86UX2 942 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SVOPQ8N4V2 548 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC185Q8N715 623 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SNX19Q92543 992 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TANKQ92844 425 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MUL1Q969V5 352 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF566Q969W8 418 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FBXL8Q96CD0 374 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NXNL1Q96CM4 212 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FBXL20Q96IG2 436 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 UGT2B28Q9BY64 529 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TPK1Q9H3S4 243 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 DKK3Q9UBP4 350 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf18Q9UK00 162 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PDE10AQ9Y233 779 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 VWA7Q9Y334 891 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 E2F8A0AVK6 867 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FAM172BPA6NC97 362 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ALG1L2C9J202 215 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 H0Y626 953 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NR5A2O00482 541 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF623O75123 536 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS23O95084 383 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FKBP9O95302 570 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM16O95361 564 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PTTG1O95997 202 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 F9P00740 461 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 AHSGP02765 367 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 NCAM1P13591 858 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 KCNE1P15382 129 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 LBPP18428 481 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 CD247P20963 164 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SAT1P21673 171 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 FUT4P22083 530 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PAX3P23760 479 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 HTR7P34969 479 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ID4P47928 161 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PPP5CP53041 499 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TPI1P60174 286 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 KCNJ8Q15842 424 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 SLC14A2Q15849 920 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 XAF1Q6GPH4 301 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms