RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 KLC4Q9NSK0 619 aa29.04■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 GALPQ9UBC7 116 aa29.04■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 DNAH14Q0VDD8 3507 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 MGAT4DA6NG13 374 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF806P0C7X5 589 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 ENGP17813 658 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 CCR7P32248 378 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP8P85298 464 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 CTBSQ01459 385 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 SPEM2Q0P670 501 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 LRP8Q14114 963 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 NAPRTQ6XQN6 538 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 OR2L2Q8NH16 312 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 ELMO1Q92556 727 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 GAREM1Q9H706 876 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 SLC39A10Q9ULF5 831 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 KCNK6Q9Y257 313 aa29.03■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 SDC3O75056 442 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 VPS26AO75436 327 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 CHN1P15882 459 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 RXRGP48443 463 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf61Q13536 156 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 DCLK2Q8N568 766 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 GPR21Q99679 349 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 OLFM1Q99784 485 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 CAB39LQ9H9S4 337 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 IL21RQ9HBE5 538 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 TAS2R13Q9NYV9 303 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 PROB1E7EW31 1015 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 GSTM1P09488 218 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 VCLP18206 1134 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 AK4P27144 223 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEA12P43365 314 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 CLCN7P51798 805 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 PGGT1BP53609 377 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 GSTM4Q03013 218 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 NFE2L1Q14494 772 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 SHBQ15464 509 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 PIM3Q86V86 326 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 OR2I1PQ8NGU4 316 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 APOPT1Q96IL0 206 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 SPASTQ9UBP0 616 aa29.02■■■□□ 2.24
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GTQ1 180 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 LNP1A1A4G5 178 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 TM9SF1O15321 606 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 PIAS2O75928 621 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 ZWINTO95229 277 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 CER1O95813 267 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 PYGBP11216 843 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 FDXRP22570 491 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 AOAHP28039 575 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 TAS2R39P59534 338 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 POU4F1Q01851 419 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 USP10Q14694 798 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 OTOAQ7RTW8 1153 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 CFAP206Q8IYR0 622 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 MDM1Q8TC05 714 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 HM13Q8TCT9 377 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 GPBAR1Q8TDU6 330 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 LMX1AQ8TE12 382 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa29.01■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL33A6NCF5 533 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 DFNA5O60443 496 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINB8P50452 374 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 IL9RQ01113 521 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 DMPKQ09013 629 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 MPP2Q14168 576 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 NRROSQ86YC3 692 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 SPNS2Q8IVW8 549 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 DENND1AQ8TEH3 1009 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 PHOX2BQ99453 314 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 SLC30A3Q99726 388 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 GSDMCQ9BYG8 508 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 LATS2Q9NRM7 1088 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 SEMA4GQ9NTN9 838 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa29■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 KCNJ13O60928 360 aa28.99■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 CD9P21926 228 aa28.99■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 ACTR1BP42025 376 aa28.99■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 SLC12A2P55011 1212 aa28.99■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 ACTR1AP61163 376 aa28.99■■■□□ 2.23
ECHS1-201ENST00000368547 GUCY1A3Q02108 690 aa28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms