RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 ABCG2Q9UNQ0 655 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 CAPN15O75808 1086 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 CRYZL1O95825 349 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 CHRNGP07510 517 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 MAPK9P45984 424 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 IRF9Q00978 393 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ZBED5Q49AG3 693 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 MTX3Q5HYI7 312 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 DGKKQ5KSL6 1271 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 GARNL3Q5VVW2 1013 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 SERPINA9Q86WD7 417 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 OFCC1Q8IZS5 231 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 GMPPBQ9Y5P6 360 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 UROSP10746 265 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 IFNGR2P38484 337 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 SRP54P61011 504 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 RALGPS1Q5JS13 557 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 DGKBQ9Y6T7 804 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 NEMP2A6NFY4 417 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 CAPZA2P47755 286 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ACTR3P61158 418 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 MSANTD2Q6P1R3 559 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 SPPL2CQ8IUH8 684 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 OR2T34Q8NGX1 318 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 OR2T3Q8NH03 318 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ZFP28Q8NHY6 868 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 SEC14L1Q92503 715 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 SCLYQ96I15 445 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ANGPT4Q9Y264 503 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 C9JVG2 144 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 H3BM21 787 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 POP4O95707 220 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 NOS3P29474 1203 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ENTPD1P49961 510 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 GLYATQ6IB77 296 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 RELL1Q8IUW5 271 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 GALNT12Q8IXK2 581 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 UBR7Q8N806 425 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 TP53INP1Q96A56 240 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 COL26A1Q96A83 441 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 TMCO6Q96DC7 493 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF285Q96NJ3 590 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 HBEGFQ99075 208 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 CIB1Q99828 191 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ISPDA4D126 451 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 H3BSA7 217 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 DHFRP00374 187 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 GSTT2P0CG29 244 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 GSTT2BP0CG30 244 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 PPIBP23284 216 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 KIR3DL1P43629 444 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 TBC1D25Q3MII6 688 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 TRIM40Q6P9F5 258 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ARMC8Q8IUR7 673 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 WDTC1Q8N5D0 677 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 SIGLEC10Q96LC7 697 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 DMRTB1Q96MA1 342 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 MNTQ99583 582 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 EPB41L4BQ9H329 900 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 SMOC2Q9H3U7 446 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ARL5AQ9Y689 179 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 PDPK1O15530 556 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 CNPP09543 421 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 IFI30P13284 250 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 FOSL2P15408 326 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 OR2B6P58173 313 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 GALNT2Q10471 571 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 IL18R1Q13478 541 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 TCEA2Q15560 299 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ANXA8L1Q5VT79 327 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 CHST9Q7L1S5 443 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 LEMD2Q8NC56 503 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 OR13C4Q8NGS5 318 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ATG10Q9H0Y0 220 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 CRTAC1Q9NQ79 661 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 FNIP2Q9P278 1114 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ADGRE2Q9UHX3 823 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ATG13O75143 517 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 OR4F21O95013 312 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 CLDN9O95484 217 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 SERPINA1P01009 418 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 ITGA2P17301 1181 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 MYL12AP19105 171 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 PAICSP22234 425 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 PRKCHP24723 683 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRK-204ENST00000368210 SKP1P63208 163 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms