RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 SNX20Q7Z614 316 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ANGPTL1O95841 491 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 OMA1Q96E52 524 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SUSD3Q96L08 255 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 BCAS3Q9H6U6 928 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ABCB8Q9NUT2 735 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CNTN3Q9P232 1028 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 Q9Y3F1 56 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEB17A8MXT2 336 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 NRP1O14786 923 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CDH3P22223 829 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB46Q86UZ6 589 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ESAMQ96AP7 390 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PIGVQ9NUD9 493 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TFPIP10646 304 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TAF8Q7Z7C8 310 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ZZZ3Q8IYH5 903 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PARP8Q8N3A8 854 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 OR10A6Q8NH74 314 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 C5orf34Q96MH7 638 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 GPR88Q9GZN0 384 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CIDEBQ9UHD4 219 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FAM149AA5PLN7 773 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 K7EPI3 171 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TWNKQ96RR1 684 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 LPIN3Q9BQK8 851 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0U1RQF3 1178 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ENPP3O14638 875 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CEP68Q76N32 757 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PIGWQ7Z7B1 504 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ILVBLA1L0T0 632 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 NFKBIEO00221 500 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS3O15072 1205 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MT-ND1P03886 318 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ETS2P15036 469 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3R6Q5UE93 754 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD46Q86W74 232 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CPNE8Q86YQ8 564 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJB8Q8NHS0 232 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FAM92AA1XBS5 289 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CHST10O43529 356 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SSNA1O43805 119 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FADS2O95864 444 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 DNM1LO00429 736 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TBX18O95935 607 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PRKAR1AP10644 381 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 HKDC1Q2TB90 917 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MINDY3Q9H8M7 445 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R1Q9NYW7 299 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FBXL22Q6P050 247 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC17Q8N6Y2 441 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 BORCS5Q969J3 196 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 LMLNQ96KR4 655 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TAF4O00268 1085 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 VITQ6UXI7 678 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SLCO6A1Q86UG4 719 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MCM8Q9UJA3 840 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN15O75808 1086 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CCNFP41002 786 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CCT3P49368 545 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 DLG1Q12959 904 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MIPEPQ99797 713 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 DPEP2Q9H4A9 486 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD11O00231 422 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SLC31A1O15431 190 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SP2Q02086 613 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM63BQ5T3F8 832 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TPK1Q9H3S4 243 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 UBAP1Q9NZ09 502 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 POMPQ9Y244 141 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FFAR2O15552 330 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CD247P20963 164 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CARD16Q5EG05 197 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 GPR65Q8IYL9 337 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SVOPLQ8N434 492 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FLCNQ8NFG4 579 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 OR13C4Q8NGS5 318 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 METTL21AQ8WXB1 218 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 RNF39Q9H2S5 420 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms