RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYNCQ9H7C4 482 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 OLFML3Q9NRN5 406 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMACRQ9UHK6 382 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNK7Q9Y2U2 307 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FLT1P17948 1338 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITIH6Q6UXX5 1313 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC72A6NJI9 287 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6C76A6NM76 312 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 VILLO15195 856 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSPG5O95196 566 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIFP15018 202 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRLRP16471 622 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNB3P16520 340 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGA3P26006 1051 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP2K2P36507 400 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 RXRGP48443 463 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRKAA1Q13131 559 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRF3Q14653 427 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCN2Q15485 313 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 DLG2Q15700 870 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 C14orf177Q52M58 125 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALS2CLQ60I27 953 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF790Q6PG37 636 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 C4orf50Q6ZRC1 276 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFSD6Q6ZSS7 791 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH2D5Q6ZV89 423 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLD3Q8IV08 490 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM190Q8WZ59 177 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTERF3Q96E29 417 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 HHATLQ9HCP6 504 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIX2Q9NPC8 291 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 COQ3Q9NZJ6 369 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNJ14Q9UNX9 436 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 LNP1A1A4G5 178 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELOVL7A1L3X0 281 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEB17A8MXT2 336 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 B4DLN1 442 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLOD2O00469 737 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC22A2O15244 555 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLPTM1O96005 669 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV1-44P01699 117 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD48P09326 243 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLA2G4BP0C869 781 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACP2P11117 423 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 VEGFCP49767 419 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH11P55287 796 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 MC1RQ01726 317 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1644Q3SXP7 199 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR20Q8TBZ3 569 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM81BQ96LP2 452 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASCL2Q99929 193 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABHD6Q9BV23 337 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTN4RQ9BZR6 473 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 PELI2Q9HAT8 420 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2orf42Q9NWW7 574 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC7A7Q9UM01 511 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 STK36Q9NRP7 1315 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 FSD2A1L4K1 749 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMD14O00487 310 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF883P0CG24 379 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPREB1P12018 145 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUOXP51687 545 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNJ10P78508 379 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMF1P82094 1093 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXCL9Q07325 125 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGA9Q13797 1035 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 MELKQ14680 651 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTDC1Q4AE62 458 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB41Q5JT25 222 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 FFAR4Q5NUL3 377 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGEF16Q5VV41 709 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMCO3Q6UWJ1 677 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 HAUS6Q7Z4H7 955 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJC22Q8N4W6 341 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM143Q96AN5 459 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-552P-201ENST00000362869 WBP1Q96G27 269 aa2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms