RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356537.8

CCDC25-201, Transcript of coiled-coil domain containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC25, Length 3,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25-201ENST00000356537 TLL1O43897 1013 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 KATNA1O75449 491 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 LEFTY1O75610 366 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 MLYCDO95822 493 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 CISD3P0C7P0 127 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 PTPN2P17706 415 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 PFKLP17858 780 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 MAPK8P45983 427 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 KIF19Q2TAC6 998 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 XKR5Q6UX68 686 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 DET1Q7L5Y6 550 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ELMOD1Q8N336 334 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 FOXJ1Q92949 421 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 FBXO10Q9UK96 956 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 LINGO3P0C6S8 592 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 SYN1P17600 705 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ITGALP20701 1170 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 WEE1P30291 646 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 STX5Q13190 355 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 POM121L1PQ3SYA9 428 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 MIER2Q8N344 545 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 IPPKQ9H8X2 491 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 CRLS1Q9UJA2 301 aa9.3□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 AOAHP28039 575 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ETV3P41162 512 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 FPGSQ05932 587 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ADGRE1Q14246 886 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 KIAA0040Q15053 153 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 TRIP10Q15642 601 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 MMEL1Q495T6 779 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 GPR33Q49SQ1 333 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 RABL3Q5HYI8 236 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 NXPE3Q969Y0 559 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 APOL5Q9BWW9 433 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 CEP44Q9C0F1 390 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ITM2BQ9Y287 266 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 SNX2O60749 519 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ARSIQ5FYB1 569 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ZFYVE19Q96K21 471 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 SERPINI1Q99574 410 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 CD244Q9BZW8 370 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 MARK1Q9P0L2 795 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 GULP1Q9UBP9 304 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 PDE10AQ9Y233 779 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 PCM1Q15154 2024 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 CARNS1A5YM72 827 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 CYP17A1P05093 508 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 TIMP2P16035 220 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 CDKL1Q00532 357 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 HERVK_113Q902F9 699 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 LRRC58Q96CX6 371 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 TMEM74Q96NL1 305 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 GCNAQ96QF7 691 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 KLHL4Q9C0H6 718 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 CROTQ9UKG9 612 aa9.29□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 PRRT4C9JH25 899 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 AREL1O15033 823 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 G6PDP11413 515 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 IDO1P14902 403 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 VIPR2P41587 438 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 NSG1P42857 185 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ERVK-8P63133 956 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 GRIN2CQ14957 1233 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 IRGCQ6NXR0 463 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 Q6ZVL8 140 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 USP45Q70EL2 814 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.28□□□□□ -0.92
CCDC25-201ENST00000356537 ROPN1LQ96C74 230 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms