RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 TPSB2P20231 275 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TPSAB1Q15661 275 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GPR142Q7Z601 462 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 OR4C6Q8NH72 309 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 IL31RAQ8NI17 732 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TBATAQ96M53 351 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 FKBP7Q9Y680 259 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PTPRJQ12913 1337 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 E9PAM4 449 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PER2O15055 1255 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ADAMDEC1O15204 470 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CCL16O15467 120 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 AHCYP23526 432 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 IDNKQ5T6J7 187 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SATL1Q86VE3 508 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CPA6Q8N4T0 437 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SPERTQ8NA61 448 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 FAM110BQ8TC76 370 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SH3D21A4FU49 640 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 REM1O75628 298 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PRAMEF1O95521 474 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 NDST3O95803 873 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CYP3A7P24462 503 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ECT2LQ008S8 904 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 LAPTM5Q13571 262 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PAOXQ6QHF9 649 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 OR10A6Q8NH74 314 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MAFFQ9ULX9 164 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SLC15A5A6NIM6 579 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 KERAO60938 352 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SLURP2P0DP57 97 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ZNF823P16415 610 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PDPRQ8NCN5 879 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 STYXQ8WUJ0 223 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SCAMP1O15126 338 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ATF6P18850 670 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 IL12BP29460 328 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TCF7L1Q9HCS4 588 aa15.87■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CHIT1Q13231 466 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 XYLT1Q86Y38 959 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GJD3Q8N144 294 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ZSWIM3Q96MP5 696 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ZNF639Q9UID6 485 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 RUNDC3AQ59EK9 446 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SLC8B1Q6J4K2 584 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PRSS58Q8IYP2 241 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 AGAP2Q99490 1192 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 IL1RAPQ9NPH3 570 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SCELO95171 688 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GBE1Q04446 702 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ECHDC2Q86YB7 292 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 DEFB118Q96PH6 123 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CPXM1Q96SM3 734 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 LHX5Q9H2C1 402 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.131e-5■■■□□ 17.8
RXRA-201ENST00000356384 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 LCP2Q13094 533 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MAP2K5Q13163 448 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 IFT27Q9BW83 186 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 HMGXB4Q9UGU5 601 aa15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ENPP3O14638 875 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ORC5O43913 435 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 OR4F21O95013 312 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 IL17AQ16552 155 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CNTD1Q8N815 330 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GBA3Q9H227 469 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CERS4Q9HA82 394 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TVP23BQ9NYZ1 205 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 LRRC72A6NJI9 287 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GNB5O14775 395 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SLC35G6P0C7Q6 338 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PGAM2P15259 253 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GRK6P43250 576 aa15.85■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GLUD2P49448 558 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms