RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
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SH3BP2-201ENST00000356331 PDYNP01213 254 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SNAPC1Q16533 368 aa10.49□□□□□ -0.73
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SH3BP2-201ENST00000356331 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
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