RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 LZICQ8WZA0 190 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CRB3Q9BUF7 120 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LGR4Q9BXB1 951 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LRRN3Q9H3W5 708 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MIEF1Q9NQG6 463 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 EBF1Q9UH73 591 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa4.37□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 RAXQ9Y2V3 346 aa4.37□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JNG1 304 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEB16A2A368 324 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RRP9O43818 475 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SUPT7LO94864 414 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 BMP10O95393 424 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 STMN1P16949 149 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 RPL22P35268 128 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SSR2P43308 183 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PGDP52209 483 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 STX1BP61266 288 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HPCAP84074 193 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 DPYSL3Q14195 570 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 NAA25Q14CX7 972 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TBCCQ15814 346 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MROH9Q5TGP6 573 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PNCKQ6P2M8 343 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 GUSBP11Q6P575 273 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00696Q6ZRV3 163 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 LIMS2Q7Z4I7 341 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 ACTRT1Q8TDG2 376 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 STYXQ8WUJ0 223 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 FGF21Q9NSA1 209 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 SELENONQ9NZV5 590 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MARK1Q9P0L2 795 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 A0A0J9YYE9 177 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0U1RQS6 177 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 CAPN8A6NHC0 703 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CASKO14936 926 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PIAS2O75928 621 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 DLSTP36957 453 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PRKAG1P54619 331 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TRAF2Q12933 501 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 CTBP1Q13363 440 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 NOMO1Q15155 1222 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 VWA2Q5GFL6 755 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 MACC1Q6ZN28 852 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ADIPOR2Q86V24 386 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KCNMB4Q86W47 210 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PPIL6Q8IXY8 311 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 KCT2Q8NC54 265 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SCRN2Q96FV2 425 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TEKT5Q96M29 485 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 PHOX2BQ99453 314 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 BCAP29Q9UHQ4 241 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-201ENST00000348564 ARL5AQ9Y689 179 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PI4KAP42356 2102 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 C19orf67A6NJJ6 358 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 STMND1H3BQB6 276 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 COPEO14579 308 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SCRG1O75711 98 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 SUN1O94901 812 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 POU2F2P09086 479 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP4.36□□□□□ -1.71
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