RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340074.9

UBE3B-201, Transcript of ubiquitin protein ligase E3B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE3B, Length 1,448 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3B-201ENST00000340074 PDHA2P29803 388 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 ELK3P41970 407 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 PREPP48147 710 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 GPLD1P80108 840 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 BRD3Q15059 726 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CENPUQ71F23 418 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 PIM3Q86V86 326 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 OR10G6Q8NH81 332 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 C12orf66Q96MD2 445 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 TCF12Q99081 682 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 NAT9Q9BTE0 207 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 RAB17Q9H0T7 212 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 P2RY12Q9H244 342 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 UCK1Q9HA47 277 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.92□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 F8W8V4 182 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 TTC4O95801 387 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CSF2RBP32927 897 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 MAPK9P45984 424 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 EPHA4P54764 986 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 SLC7A5Q01650 507 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CFHR1Q03591 330 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CALCOCO2Q13137 446 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 RPA4Q13156 261 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CTBP1Q13363 440 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 TUBB2AQ13885 445 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 GPR18Q14330 331 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 C8orf74Q6P047 294 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 LRRC6Q86X45 466 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 KRT222Q8N1A0 295 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 LPGAT1Q92604 370 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 LRRC39Q96DD0 335 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CFAP36Q96G28 342 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CARD6Q9BX69 1037 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.91□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 LILRA5A6NI73 299 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 PFDN6O15212 129 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 DUX1O43812 170 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 FMO4P31512 558 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CCR7P32248 378 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 INHBCP55103 352 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 SQSTM1Q13501 440 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 TRADDQ15628 312 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 KCNMB4Q86W47 210 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 ANKMY2Q8IV38 441 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 TMEM74Q96NL1 305 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 BIRC8Q96P09 236 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 ZMYND15Q9H091 742 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UBE3B-201ENST00000340074 E7ESA3 106 aa14.89□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms