RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340006.6

CSRP1-201, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRP1, Length 1,952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1-201ENST00000340006 CD200R1Q8TD46 325 aa14.49□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
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CSRP1-201ENST00000340006 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.49□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.49□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.49□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.49□□□□□ -0.09
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CSRP1-201ENST00000340006 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 KLHL33A6NCF5 533 aa14.47□□□□□ -0.09
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CSRP1-201ENST00000340006 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.47□□□□□ -0.09
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CSRP1-201ENST00000340006 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 HOXD12P35452 270 aa14.47□□□□□ -0.09
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CSRP1-201ENST00000340006 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
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CSRP1-201ENST00000340006 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
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CSRP1-201ENST00000340006 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.47□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 H3BM21 787 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 COPEO14579 308 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 CBSLP0DN79 551 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 PDHA2P29803 388 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 CBSP35520 551 aa14.46□□□□□ -0.09
CSRP1-201ENST00000340006 ACTR1BP42025 376 aa14.46□□□□□ -0.09
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