RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 ABRAXAS2Q15018 415 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 NXPE1Q8N323 547 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM74Q96NL1 305 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF208Q9H0X6 261 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 IPPKQ9H8X2 491 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 SUN2Q9UH99 717 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.42■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 TGM5O43548 720 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM16O95361 564 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 GUCA1CO95843 209 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 SRCP12931 536 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 GSTT1P30711 240 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 RPL5P46777 297 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 VEGFBP49765 207 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 PRKG2Q13237 762 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR33Q49SQ1 333 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC2A7Q6PXP3 512 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 FIBCD1Q8N539 461 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR26Q8NDV2 337 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 RHBDF1Q96CC6 855 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 AURKCQ9UQB9 309 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 OR6B1O95007 311 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 CLPTM1O96005 669 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 GPIP06744 558 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 G6PDP11413 515 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 SERPINA4P29622 427 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 POLE2P56282 527 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 NR6A1Q15406 480 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 NANOGP8Q6NSW7 305 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 IYDQ6PHW0 289 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF165Q6ZSG1 346 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBP1Q9H171 429 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 NANOGQ9H9S0 305 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 PADI4Q9UM07 663 aa20.41■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1B0GTW7 788 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 DLGAP1O14490 977 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 KATNA1O75449 491 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 NPPAP01160 153 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 NHSL2Q5HYW2 709 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR65Q8IYL9 337 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 APOL5Q9BWW9 433 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 USP22Q9UPT9 525 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.4■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP10A1A4S6 786 aa20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 DYTNA2CJ06 578 aa20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 A8MX80 341 aa20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ARNTLO00327 626 aa20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 GJA1P17302 382 aa20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 MILR1Q7Z6M3 343 aa20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD60Q9BZ19 345 aa20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.39■□□□□ 0.86
KCNQ1-202ENST00000335475 LEFTY2O00292 366 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 JAK1P23458 1154 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 HRH2P25021 359 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 HTR1EP28566 365 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 HMOX2P30519 316 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 GDF5P43026 501 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 CCT8P50990 548 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 SEMG2Q02383 582 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 KIAA0040Q15053 153 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 FUT11Q495W5 492 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.39■□□□□ 0.85
KCNQ1-202ENST00000335475 IFNEQ86WN2 208 aa20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms