RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 SOD2P04179 222 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 UGT2B4P06133 528 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 GNAO1P09471 354 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 UFM1P61960 85 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 ARHGEF7Q14155 803 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 MAPK11Q15759 364 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 C6orf10Q5SRN2 563 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 GAREM2Q75VX8 874 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CACUL1Q86Y37 369 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CDC26Q8NHZ8 85 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 SEPHS2Q99611 448 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa9.96□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 PITPNM1O00562 1244 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 POLD2P49005 469 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 NFYCQ13952 458 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 NR1D2Q14995 579 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 NR6A1Q15406 480 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 FGD3Q5JSP0 725 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM26Q6ZUK4 368 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 MIER2Q8N344 545 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 FIBCD1Q8N539 461 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CD200R1Q8TD46 325 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 ING5Q8WYH8 240 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 PYCR2Q96C36 320 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 SPAG4Q9NPE6 437 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 FNIP2Q9P278 1114 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 C7orf72A4D263 438 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 EPOP01588 193 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CAPN1P07384 714 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CR2P20023 1033 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 PRDX6P30041 224 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 TTPAP49638 278 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CCT8P50990 548 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 DGKQP52824 942 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 HMGCS1Q01581 520 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 LCP2Q13094 533 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 PLCL1Q15111 1095 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CHRNA6Q15825 494 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CYP2A13Q16696 494 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 Q6ZNX1 250 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 SPRED2Q7Z698 418 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 PELI3Q8N2H9 469 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 KIAA1191Q96A73 305 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 PLD4Q96BZ4 506 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 SLC29A1Q99808 456 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 KLHL25Q9H0H3 589 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 EPS8L2Q9H6S3 715 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 TRIM38O00635 465 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 INPP4BO15327 924 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 NOL3O60936 208 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 KERAO60938 352 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CHEK2O96017 543 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 COL6A1P12109 1028 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 OGNP20774 298 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CD247P20963 164 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 LMAN2Q12907 356 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 TGFBIQ15582 683 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CANT1Q8WVQ1 401 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 TCEAL4Q96EI5 215 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 FAR2Q96K12 515 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 PPM1MQ96MI6 270 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM175Q9BSA9 504 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 LHX3Q9UBR4 397 aa9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
FOXN4-201ENST00000299162 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms