RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293880.9

SSRP1-202, Transcript of structure specific recognition protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SSRP1, Length 6,296 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1-202ENST00000293880 WRBO00258 174 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 SLC30A4O14863 429 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 C2P06681 752 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 OR2B6P58173 313 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CLCQ05315 142 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 SEMA3AQ14563 771 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 BBS12Q6ZW61 710 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CRYBG2Q8N1P7 616 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 TVP23BQ9NYZ1 205 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 KCNE2Q9Y6J6 123 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 RIIAD1A6NNX1 92 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 C22orf31O95567 290 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 ITIH1P19827 911 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CCDC120Q96HB5 630 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CPXM1Q96SM3 734 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 XKR8Q9H6D3 395 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 GLOD4Q9HC38 313 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 DPP7Q9UHL4 492 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 IRGMA1A4Y4 181 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 TLR5O60602 858 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 DRG2P55039 364 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 HMCESQ96FZ2 354 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 ZNF558Q96NG5 402 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 COPS8Q99627 209 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 RAI2Q9Y5P3 530 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 ARL5AQ9Y689 179 aa15.94■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 SMIM30A4D0T7 59 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 FABP12A6NFH5 140 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 LIN52Q52LA3 116 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 HM13Q8TCT9 377 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 GAL3ST4Q96RP7 486 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 MYPNQ86TC9 1320 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 MATN2O00339 956 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 DNM1LO00429 736 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CLDN9O95484 217 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CD247P20963 164 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 GNPDA1P46926 289 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 EEF1DP3Q658K8 133 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CPT1BQ92523 772 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 PLEKHA1Q9HB21 404 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 OR2AT4A6NND4 320 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 C17orf64Q86WR6 236 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 RNF208Q9H0X6 261 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 MAU2Q9Y6X3 613 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 C5orf51A6NDU8 294 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 OR1F1O43749 312 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 GABRR2P28476 465 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 DUSP4Q13115 394 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 ACAP2Q15057 778 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 NOMO1Q15155 1222 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 SNX20Q7Z614 316 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 GRPEL2Q8TAA5 225 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 PXDNQ92626 1479 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 PGAM2P15259 253 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 PTNP21246 168 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 GRHL3Q8TE85 626 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 PCDHAC1Q9H158 963 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 TMEM27Q9HBJ8 222 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.93■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 AURKAO14965 403 aa15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 TGDSO95455 350 aa15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 TUBG1P23258 451 aa15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 PGDP52209 483 aa15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 OLR1P78380 273 aa15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 BNIP1Q12981 228 aa15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 LAPTM5Q13571 262 aa15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 PGAM4Q8N0Y7 254 aa15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 NODALQ96S42 347 aa15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 GBA3Q9H227 469 aa15.92■□□□□ 0.14
SSRP1-202ENST00000293880 KCNN2Q9H2S1 579 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms