RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 FAM105AQ9NUU6 356 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 MKS1Q9NXB0 559 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 RNF11Q9Y3C5 154 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ABCB7O75027 752 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 AGXTP21549 392 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 NR4A2P43354 598 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 TAF10Q12962 218 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 VN1R5Q7Z5H4 357 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 TMEM86AQ8N2M4 240 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 C2orf69Q8N8R5 385 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 TRIM63Q969Q1 353 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 NPY6RQ99463 290 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 NMUR1Q9HB89 426 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ERVK-18Q9QC07 812 aa15.5■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 SLC22A2O15244 555 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 APLP1P51693 650 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 CDC42P60953 191 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 NEK5Q6P3R8 708 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 PLET1Q6UQ28 207 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF534Q76KX8 674 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 FCRL5Q96RD9 977 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ANKDD1BA6NHY2 528 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 DGKAP23743 735 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 KIR3DL1P43629 444 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 PFKPQ01813 784 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 KRT74Q7RTS7 529 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 C3orf30Q96M34 536 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 SMIM18P0DKX4 95 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 STK40Q8N2I9 435 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 PPP1R14BQ96C90 147 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 UCKL1Q9NWZ5 548 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 SLAMF8Q9P0V8 285 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ZNF222Q9UK12 451 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 RPS6KA6Q9UK32 745 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.49■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ARID1AO14497 2285 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 MYL12AP19105 171 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ARRB2P32121 409 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ACVRL1P37023 503 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ALDH3A2P51648 485 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 OR2B6P58173 313 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ERVK-8P63133 956 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 GTF2H2Q13888 395 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 XKR6Q5GH73 641 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 FRS2Q8WU20 508 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 PIH1D2Q8WWB5 315 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 TINF2Q9BSI4 451 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 NUP205Q92621 2012 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 NRCAMQ92823 1304 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 PLSCR1O15162 318 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 SLC7A4O43246 635 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 MITFO75030 526 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 QPRTQ15274 297 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 TIGD6Q17RP2 521 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 DCDC5Q6ZRR9 648 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 IGFN1Q86VF2 1251 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 ASZ1Q8WWH4 475 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 TP53INP1Q96A56 240 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 GLUD1P00367 558 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 CDH1P12830 882 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 DPP6P42658 865 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 CLDN10P78369 228 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 BCL2L1Q07817 233 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 SIRPB2Q5JXA9 342 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 RAB43Q86YS6 212 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 PDPRQ8NCN5 879 aa15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP43-201ENST00000285199 NUP98P52948 1817 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms