RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 XKR5Q6UX68 686 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF217Q8TC41 542 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC106Q9BWC9 280 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SAR1AQ9NR31 198 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXL12Q9NXK8 326 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SLCO2B1O94956 709 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GUCA1CO95843 209 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 C7P10643 843 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ELMO1Q92556 727 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ATXN10Q9UBB4 475 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FIS1Q9Y3D6 152 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SNX2O60749 519 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TM7SF2O76062 418 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FSBPO95073 299 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDH8O95206 1070 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PEX19P40855 299 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 BTKQ06187 659 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 STARD3Q14849 445 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 AGERQ15109 404 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKS6Q68DC2 871 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SDE2Q6IQ49 451 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM220Q6QAJ8 160 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ASRGL1Q7L266 308 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 AGAP11Q8TF27 550 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ASB11Q8WXH4 323 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 COX14Q96I36 57 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 LGR4Q9BXB1 951 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2AG1Q9H205 316 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CD93Q9NPY3 652 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TCF7L2Q9NQB0 619 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 E9PBE3 544 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SDHDO14521 159 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RAD51BO15315 384 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL41O60662 606 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FTH1P02794 183 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FGF4P08620 206 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 LCP2Q13094 533 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PNCKQ6P2M8 343 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNA7Q96RP8 456 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RDH14Q9HBH5 336 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TMCO1Q9UM00 188 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE10AQ9Y233 779 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT87PA6NCN2 255 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GFYI3L273 518 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC22O60826 627 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ATG13O75143 517 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP8P85298 464 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 STON2Q8WXE9 905 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-CQ95604 372 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GUCD1Q96NT3 240 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 QSOX1O00391 747 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 KPNA5O15131 536 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms