RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251303.10

SLX1A-201, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLX1A, Length 1,091 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-201ENST00000251303 LRBAP50851 2863 aa18.5■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 LRRD1A4D1F6 860 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 LCA5LO95447 670 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 ATP1A4Q13733 1029 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 TEX44Q53QW1 395 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF789Q5FWF6 425 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 GPRC6AQ5T6X5 926 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 ARMC6Q6NXE6 501 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 NPNTQ6UXI9 565 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 FAM151BQ6UXP7 276 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 VSIG1Q86XK7 387 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 SYTL1Q8IYJ3 562 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 IQCKQ8N0W5 287 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 CLIP3Q96DZ5 547 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 C12orf66Q96MD2 445 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 WWP1Q9H0M0 922 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 UBP1Q9NZI7 540 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 C5AR2Q9P296 337 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 LCMT1Q9UIC8 334 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 POMT2Q9UKY4 750 aa18.49■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 APOL1O14791 398 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 RAPSNQ13702 412 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 NCF4Q15080 339 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 PPP2R5EQ16537 467 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 FNBP1LQ5T0N5 605 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 OR1L3Q8NH93 324 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 ASF1BQ9NVP2 202 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 SMOXQ9NWM0 555 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 SLC5A6Q9Y289 635 aa18.48■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 MGAT4DA6NG13 374 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 MSL3P1P0C860 447 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 HLA-DPA1P20036 260 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 CDH3P22223 829 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 PTPN3P26045 913 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 ITGA9Q13797 1035 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 LONRF2Q1L5Z9 754 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 SIRPB2Q5JXA9 342 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 KDELC1Q6UW63 502 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 SGSM3Q96HU1 749 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 TEKT5Q96M29 485 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 C5orf34Q96MH7 638 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 C1GALT1Q9NS00 363 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 FAM153AQ9UHL3 310 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 ACSL5Q9ULC5 683 aa18.47■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 ABCA12Q86UK0 2595 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 SPTBP11277 2137 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 TMEM150CB9EJG8 249 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 SERPINC1P01008 464 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 EPOP01588 193 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 H2AFZP0C0S5 128 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 CYP2A7P20853 494 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 PBX1P40424 430 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 CHRNA4P43681 627 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 WNT3AP56704 352 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 ZBED6P86452 979 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 PRKAA1Q13131 559 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 PTCHD3Q3KNS1 767 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 H2AFVQ71UI9 128 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 RAB43Q86YS6 212 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 OR2L2Q8NH16 312 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 RMDN2Q96LZ7 410 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 PACSIN1Q9BY11 444 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 HACD3Q9P035 362 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa18.46■□□□□ 0.55
SLX1A-201ENST00000251303 KLHL33A6NCF5 533 aa18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 ANKUB1A6NFN9 424 aa18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 MATN2O00339 956 aa18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 SLC35G4P0C7Q5 338 aa18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 MSH3P20585 1137 aa18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 NDUFS1P28331 727 aa18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 AKT1P31749 480 aa18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 ADCY2Q08462 1091 aa18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 DET1Q7L5Y6 550 aa18.45■□□□□ 0.54
SLX1A-201ENST00000251303 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms