RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc70Q9D9B0 223 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A0A286YCD0 109 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd34aB2RW11 495 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Socs2O35717 198 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 JunP05627 334 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifngr1P15261 477 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Msr1P30204 458 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Taf1cQ6PDZ2 836 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr664Q7TRP5 306 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C2cd4bQ80XU5 340 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q810N5 247 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfm2Q8BM13 448 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Camk1dQ8BW96 385 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rab36Q8CAM5 267 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr448Q8VES9 310 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spred2Q924S7 410 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spg21Q9CQC8 308 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttc25Q9D4B2 624 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Oaz3Q9R109 243 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtsQ9R1Z7 144 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ArntlQ9WTL8 632 aa20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep350E9Q309 3095 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Oas1eA0A0J9YV76 386 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv12-46A0A140T8P6 115 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem233D3Z1U7 110 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp788E9Q980 884 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r61L7N2B8 865 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nfkb1P25799 971 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pxmp2P42925 194 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TshrP47750 764 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lzts1P60853 599 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem173Q3TBT3 378 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PdprQ7TSQ8 878 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 D3Ertd751eQ8BGN2 192 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PdhxQ8BKZ9 501 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rdh12Q8BYK4 316 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sit1Q8C503 180 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgrl4Q923X1 739 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dpysl5Q9EQF6 564 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcne5Q9QZ26 143 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1110002E22RikE0CYV9 1786 aa20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2210016F16RikG3X8U3 338 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptger3P30557 365 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpx3P46412 226 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hk3Q3TRM8 922 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp868Q3UTQ6 422 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif2b4Q61749 524 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snx31Q6P8Y7 439 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Paqr9Q6TCG2 375 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Crb2Q80YA8 1282 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfyve1Q810J8 777 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B3galnt2Q8BG28 504 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam221bQ8C627 487 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxo48Q8CAT8 161 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8CC96 669 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 OptcQ920A0 328 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gstt3Q99L20 241 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttc9bQ9D6E4 239 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nmnat1Q9EPA7 285 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PyglQ9ET01 850 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mllt3A2AM29 569 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp952B0V2W4 504 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cxcr3O88410 367 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krt1P04104 637 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il1rl1P14719 567 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BdnfP21237 249 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trpv5P69744 723 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TekQ02858 1122 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alg6Q3TAE8 507 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc13a5Q67BT3 572 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mgat5bQ765H6 792 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppm1nQ8BGL1 404 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kctd11Q8K485 232 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PxnQ8VI36 591 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cryl1Q99KP3 319 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mlf2Q99KX1 247 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam122aQ9DB52 284 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pin1Q9QUR7 165 aa20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Baz2aQ91YE5 1889 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BC025446A0A087WQT1 134 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grin3aA2AIR5 1135 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itga8A2ARA8 1062 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 F2P19221 618 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp17a1P27786 507 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il11ra2P70225 432 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nt5c3bQ3UFY7 300 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nfatc2Q60591 927 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnfaip2Q61333 691 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prickle2Q80Y24 845 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fndc3aQ8BX90 1198 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clic5Q8BXK9 251 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtrf1Q8K126 446 aa20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1019Q8VGS3 310 aa20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.2 ms