RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ptger3P30557 365 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pdha2P35487 391 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tuba4aP68368 448 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Il11ra2P70225 432 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam117bQ3U3E2 584 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q3UK37 420 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Itga2Q62469 1178 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BegainQ68EF6 600 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr664Q7TRP5 306 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfyve1Q810J8 777 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppm1nQ8BGL1 404 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 D3Ertd751eQ8BGN2 192 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp6v1b1Q91YH6 513 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tspan1Q99J59 240 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp4f14Q9EP75 524 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smad9Q9JIW5 430 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aqp5Q9WTY4 265 aa17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MgamB5THE2 1827 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm21083A0A0G2JFD5 256 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r8L7N472 848 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sod3O09164 251 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cxcr3O88410 367 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hoxa9P09631 271 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Itgb7P26011 806 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pxmp2P42925 194 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cct8P42932 548 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aff3P51827 1254 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trpv5P69744 723 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp2c65Q148B1 490 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nfatc2Q60591 927 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Taf1cQ6PDZ2 836 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem270Q6UJB9 264 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr1036Q7TR85 310 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trnau1apQ80VC6 287 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prickle2Q80Y24 845 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tspan12Q8BKT6 305 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q8C4P0 716 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hid1Q8R1F6 788 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 OptcQ920A0 328 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tex19.1Q99MV2 351 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr704Q9EPF6 315 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm28363A0A087WQW2 129 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Oas1eA0A0J9YV76 386 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam131cA2ADB2 273 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Itga8A2ARA8 1062 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1700011I03RikE9PYL8 271 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp788E9Q980 884 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GzmkO35205 263 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dgcr6O35347 198 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Socs2O35717 198 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpx3P46412 226 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cog7Q3UM29 770 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm5800Q497L3 186 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MslnQ61468 625 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bcl2l1Q64373 233 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Snx31Q6P8Y7 439 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dna2Q6ZQJ5 1062 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sit1Q8C503 180 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam221bQ8C627 487 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lsm1Q8VC85 133 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nrbf2Q8VCQ3 287 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vsig1Q9D2J4 407 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 L3mbtl1A2A5N8 826 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ccdc120A2AEV7 629 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp952B0V2W4 504 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pdia2D3Z6P0 527 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm2237E9Q501 211 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ceacam3E9Q6J4 706 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm3591K7N6X2 186 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CremP27699 357 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Msr1P30204 458 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ckmt1P30275 418 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TshrP47750 764 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp3ccP48455 513 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Epb42P49222 691 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 WasP70315 520 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ctps1P70698 591 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem173Q3TBT3 378 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kctd21Q3URF8 260 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rab26Q504M8 260 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankrd13bQ5F259 626 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trpc1Q61056 793 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tfap2cQ61312 449 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpr17Q6NS65 339 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rundc3bQ6PDC0 408 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Teddm1aQ810U2 305 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr47Q8CGF6 920 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CenpiQ8K1K4 746 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nck1Q99M51 377 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gimap3Q99MI6 301 aa17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q9D5Y0 588 aa17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.1 ms