RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 SDC3O75056 442 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 VPS26AO75436 327 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 KRT38O76015 456 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SYPP08247 313 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CTSEP14091 401 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 VCLP18206 1134 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SERPINB9P50453 376 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 BLKP51451 505 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SLC12A2P55011 1212 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CDKN2DP55273 166 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 IL9RQ01113 521 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SPEM2Q0P670 501 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CASP8Q14790 479 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TMED2Q15363 201 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 HLA-BQ31612 363 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 HDXQ7Z353 690 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 AMZ2Q86W34 360 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 DCLK2Q8N568 766 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 OXR1Q8N573 874 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 OR2L2Q8NH16 312 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ELMO1Q92556 727 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 KCNJ9Q92806 393 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 GPR22Q99680 433 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 OLFM1Q99784 485 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC61Q9BV99 259 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 PPCSQ9HAB8 311 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 KLC4Q9NSK0 619 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TAS2R13Q9NYV9 303 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 GALPQ9UBC7 116 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SLC23A2Q9UGH3 650 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TBK1Q9UHD2 729 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 KCNK6Q9Y257 313 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 VWA7Q9Y334 891 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 NFS1Q9Y697 457 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.37□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 HMX2A2RU54 273 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 MGAT4DA6NG13 374 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CDH16O75309 829 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TCEA3O75764 348 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 PIAS2O75928 621 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 KRT37O76014 449 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CER1O95813 267 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ENGP17813 658 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 FDXRP22570 491 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CNTFP26441 200 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 AK4P27144 223 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CCR7P32248 378 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ACTR1BP42025 376 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CLCN7P51798 805 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 PGGT1BP53609 377 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TAS2R39P59534 338 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ACTR1AP61163 376 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 IRX4P78413 519 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ARHGAP8P85298 464 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CTBSQ01459 385 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 POU4F1Q01851 419 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF844Q08AG5 666 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf61Q13536 156 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 LRP8Q14114 963 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 NFE2L1Q14494 772 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF460Q14592 562 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 KRT71Q3SY84 523 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CEP85LQ5SZL2 805 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 LGSNQ5TDP6 509 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 UGT3A1Q6NUS8 523 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.36□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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