RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617719.4

ATXN3-251, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 1,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-251ENST00000617719 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 R4GN57 208 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 E2F8A0AVK6 867 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 GAGE12BA1L429 117 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 MACROD2A1Z1Q3 448 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 GAGE12HA6NDE8 117 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 K7EQS6 105 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 RTCAO00442 366 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 MAST4O15021 2626 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 COCHO43405 550 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 STX10O60499 249 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 ATG13O75143 517 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 RFPL3O75679 317 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 INMTO95050 263 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 EPN2O95208 641 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 FKBP9O95302 570 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SLC4A1P02730 911 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 GSTT2P0CG29 244 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 GSTT2BP0CG30 244 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 TRIM49P0CI25 452 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 TRIM49CP0CI26 452 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 ARSAP15289 507 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 NAGAP17050 411 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 DRD1P21728 446 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 CFL1P23528 166 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 HNF1BP35680 557 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 OPRD1P41143 372 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 PPP1R2P41236 205 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 GCLMP48507 274 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SEC24CP53992 1094 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 RAD23BP54727 409 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 LRRC63Q05C16 580 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 MORC3Q14149 939 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SQLEQ14534 574 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 PON2Q15165 354 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 RAB41Q5JT25 222 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 ARHGAP17Q68EM7 881 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 PM20D1Q6GTS8 502 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SPOPLQ6IQ16 392 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 TTI2Q6NXR4 508 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 KLC3Q6P597 504 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 CYB5D1Q6P9G0 228 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 TSSK4Q6SA08 328 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 WDR5BQ86VZ2 330 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 NLRP14Q86W24 1093 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 LONP2Q86WA8 852 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 NKAIN4Q8IVV8 208 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 FAM9CQ8IZT9 166 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 UBR7Q8N806 425 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 RUBCNQ92622 972 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 P3H4Q92791 437 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 ATP2A3Q93084 1043 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SLC35C1Q96A29 364 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 FAM149B1Q96BN6 582 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 OTUB2Q96DC9 234 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SMARCD1Q96GM5 515 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 CIB1Q99828 191 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 CCDC28BQ9BUN5 200 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 DUSP16Q9BY84 665 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 VCXQ9H320 206 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 FBXO44Q9H4M3 255 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 VPS37BQ9H9H4 285 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 PDP2Q9P2J9 529 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 VANGL2Q9ULK5 521 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 SCML2Q9UQR0 700 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 TMEM5Q9Y2B1 443 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-251ENST00000617719 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ATXN3-251ENST00000617719 DMXL1Q9Y485 3027 aa4.58□□□□□ -1.68
ATXN3-251ENST00000617719 ATP8B3O60423 1300 aa4.58□□□□□ -1.68
ATXN3-251ENST00000617719 SPTBN4Q9H254 2564 aa4.58□□□□□ -1.68
ATXN3-251ENST00000617719 ARHGAP10A1A4S6 786 aa4.58□□□□□ -1.68
ATXN3-251ENST00000617719 GOLGA8KD6RF30 607 aa4.58□□□□□ -1.68
ATXN3-251ENST00000617719 H3BQF6 201 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms