RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 SCAMP1O15126 338 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 BMP7P18075 431 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 HERVK_113Q902F9 699 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 MAGEA11P43364 429 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 SEC13P55735 322 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL25Q9H0H3 589 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 KCTD3Q9Y597 815 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 A8MT66 165 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKCHP24723 683 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 UBXN11Q5T124 520 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 PALMDQ9NP74 551 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 POMPQ9Y244 141 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 K7EPI3 171 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR32O75388 356 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 CCNDBP1O95273 360 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 C21orf59P57076 290 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF33AQ06730 810 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 PDZK1Q5T2W1 519 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 C14orf80Q86SX3 495 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF366Q8N895 744 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 POMGNT2Q8NAT1 580 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 PYCR2Q96C36 320 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 OR2AG1Q9H205 316 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM72CH0Y354 149 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF623O75123 536 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 MTX2O75431 263 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 RASGRP1O95267 797 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 PRPS2P11908 318 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 MTHFRP42898 656 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL35Q6PF15 583 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF44Q7L0R7 432 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM72BQ86X60 149 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 SERHL2Q9H4I8 314 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 SERHLQ9NQF3 203 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 EFCAB10A6NFE3 127 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 DLX3O60479 287 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 IL6P05231 212 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 GALTP07902 379 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 CCR3P51677 355 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 STX4Q12846 297 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 DPYSQ14117 519 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 Q6ZVU0 165 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 Q96MT0 163 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC38A2Q96QD8 506 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR22Q99680 433 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 H0YGN5 161 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 MAPK12P53778 367 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ARSIQ5FYB1 569 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTS15Q8TE58 950 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ROPN1LQ96C74 230 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 SEC14L3Q9UDX4 400 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 NFS1Q9Y697 457 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 OR6B1O95007 311 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ALOX12P18054 663 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP4F3Q08477 520 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 SERINC3Q13530 473 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 PIM3Q86V86 326 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10A6Q8NH74 314 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 KLK6Q92876 244 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 MYDGFQ969H8 173 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRJ-208ENST00000615445 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms