RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 RFXANKO14593 260 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 KMOO15229 486 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 TPPPO94811 219 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 PCDH8O95206 1070 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 USP41Q3LFD5 358 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 ADNP2Q6IQ32 1131 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 CGREF1Q99674 301 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 ULK1O75385 1050 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 LINC00032P0C843 101 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 CD40LGP29965 261 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 ALDH9A1P49189 494 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 TAS2R40P59535 323 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 ZNF781Q8N8C0 355 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 CCDC107Q8WV48 283 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 RP2O75695 350 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 PPP5CP53041 499 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 PNLIPRP1P54315 467 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 SEZ6Q53EL9 994 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 NPNTQ6UXI9 565 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 TRPV3Q8NET8 790 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 BBS4Q96RK4 519 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 OMDQ99983 421 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 CIPCQ9C0C6 399 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 KLQ9UEF7 1012 aa6.8□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 NFAT5O94916 1531 aa6.8□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 C2orf74A8MZ97 194 aa6.79□□□□□ -1.32
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CLCN3-211ENST00000613795 CKMT2P17540 419 aa6.79□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 TYMPP19971 482 aa6.79□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.79□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 SYVN1Q86TM6 617 aa6.79□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.79□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 PPA2Q9H2U2 334 aa6.79□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.79□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.79□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 KRBA1A5PL33 1030 aa6.79□□□□□ -1.32
CLCN3-211ENST00000613795 TSPAN1O60635 241 aa6.79□□□□□ -1.32
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