RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PARP9Q8IXQ6 854 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CARFQ8N187 725 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NXPE1Q8N323 547 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NEK11Q8NG66 645 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GRHL3Q8TE85 626 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAR1Q8WVX9 515 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C17orf62Q9BQA9 187 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SYTL2Q9HCH5 934 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHST11Q9NPF2 352 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AMACRQ9UHK6 382 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BTRCQ9Y297 605 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 F8P00451 2351 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 E2F3O00716 465 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MATN3O15232 486 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LCA5LO95447 670 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STSP08842 583 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDH3P22223 829 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDC16Q13042 620 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRKAA1Q13131 559 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 XRCC4Q13426 336 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IHHQ14623 411 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MLIPQ5VWP3 458 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AMZ2Q86W34 360 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COG1Q8WTW3 980 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PDZD2O15018 2839 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR6C74A6NCV1 312 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 E7EQ34 232 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HBQ1P09105 142 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PCK1P35558 622 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FOLR3P41439 243 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GALNT3Q14435 633 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CYP2A13Q16696 494 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VWA2Q5GFL6 755 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR1L3Q8NH93 324 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CNDP1Q96KN2 507 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GBP5Q96PP8 586 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRIM7Q9C029 511 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A1W2PQJ5 194 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HLA-DQB2P05538 268 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CD63P08962 238 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IL1R2P27930 398 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CD86P42081 329 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PREPP48147 710 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KRT81Q14533 505 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HIF1AQ16665 826 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MAML1Q92585 1016 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EID2BQ96D98 161 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SCINQ9Y6U3 715 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF749O43361 778 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MFSD11O43934 449 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DIAPH2O60879 1101 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PIRTP0C851 137 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RARAP10276 462 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FERP16591 822 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BPIP17213 487 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCNCP24863 283 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HTR1EP28566 365 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SOX8P57073 446 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms