RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	BPTF	Q12830	3046 aa		12.11	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900		A0A0G2JNG1	304 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	KPNA5	O15131	536 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	F3	P13726	295 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	CKMT2	P17540	419 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	ACP1	P24666	158 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	GPX6	P59796	221 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	KIR2DS5	Q14953	304 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	NR0B2	Q15466	257 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	TCEA2	Q15560	299 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	IYD	Q6PHW0	289 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	XKR5	Q6UX68	686 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	NAGS	Q8N159	534 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	AVL9	Q8NBF6	648 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	DEFB124	Q8NES8	71 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	NAT14	Q8WUY8	206 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	UBXN4	Q92575	508 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	CDKL2	Q92772	493 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	ZFAT	Q9P243	1243 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900		U3KQA8	63 aa		12.1	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	FAM159B	A6NKW6	160 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900		B4DGG1	531 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	HAUS5	O94927	633 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	KCNK5	O95279	499 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	C1QA	P02745	245 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	AHSG	P02765	367 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	PNLIP	P16233	465 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	GABRB3	P28472	473 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	FMO4	P31512	558 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	STX2	P32856	288 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	PHB	P35232	272 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	FASLG	P48023	281 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	DAB2	P98082	770 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	ILK	Q13418	452 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	NFE2L1	Q14494	772 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	KYNU	Q16719	465 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	SFRP1	Q8N474	314 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	ELMO1	Q92556	727 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	NAT6	Q93015	286 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	FUT8	Q9BYC5	575 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	COG4	Q9H9E3	785 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	PADI4	Q9UM07	663 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		12.09	□□□□□ -0.47
PKN1-208	ENST00000586900	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	SNX2	O60749	519 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	GPC4	O75487	556 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	TRIM16	O95361	564 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	EML2	O95834	649 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	GP1BA	P07359	652 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CDK4	P11802	303 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	BRAF	P15056	766 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	GLB1	P16278	677 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CD9	P21926	228 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	AOAH	P28039	575 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CCR7	P32248	378 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	HAL	P42357	657 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CD151	P48509	253 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	MPP1	Q00013	466 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	NAB1	Q13506	487 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		12.08	□□□□□ -0.48
PKN1-208	ENST00000586900	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48

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