RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	RARRES3	Q9UL19	164 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	MGAT4D	A6NG13	374 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	KATNA1	O75449	491 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	KIAA0754	O94854	1291 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	AGT	P01019	485 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	FGF5	P12034	268 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	NDUFS1	P28331	727 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	RBL1	P28749	1068 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	RWDD2B	P57060	319 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TUBB3	Q13509	450 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	METRNL	Q641Q3	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	OOSP2	Q86WS3	158 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TC2N	Q8N9U0	490 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	OR8K5	Q8NH50	307 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ASB8	Q9H765	288 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	SPTA1	P02549	2419 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	KALRN	O60229	2985 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	C21orf140	B9A014	251 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	SPAG6	O75602	509 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	RBP3	P10745	1247 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ITGAL	P20701	1170 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	NFKB2	Q00653	900 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	DET1	Q7L5Y6	550 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CARF	Q8N187	725 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	C12orf66	Q96MD2	445 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PANX2	Q96RD6	677 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TRIM4	Q9C037	500 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CROT	Q9UKG9	612 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	POLH	Q9Y253	713 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TLCD2	A6NGC4	264 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	MATN2	O00339	956 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	KCNN4	O15554	427 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	RECK	O95980	971 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PTPN7	P35236	360 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	CTSC	P53634	463 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	SH3BP2	P78314	561 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	HSD11B2	P80365	405 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	NFE2L1	Q14494	772 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	RANBP10	Q6VN20	620 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	OR2L2	Q8NH16	312 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	COPS8	Q99627	209 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	ARL5A	Q9Y689	179 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	OR5K3	A6NET4	321 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-208	ENST00000579743	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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