RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	RORA	P35398	523 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ITGA1	P56199	1179 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CDK18	Q07002	472 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	GTF2H3	Q13889	308 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PLCL1	Q15111	1095 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SLC14A2	Q15849	920 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	MED25	Q71SY5	747 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CARF	Q8N187	725 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CPT1B	Q92523	772 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	C19orf60	Q96EN9	201 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	GPR83	Q9NYM4	423 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	C5AR2	Q9P296	337 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	MAP10	Q9P2G4	905 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	BTRC	Q9Y297	605 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	NDST3	O95803	873 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	GJC1	P36383	396 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	VAV2	P52735	878 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CTSC	P53634	463 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	RRAD	P55042	308 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TAS2R40	P59535	323 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	NR6A1	Q15406	480 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	METRNL	Q641Q3	311 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	OOSP2	Q86WS3	158 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZBTB2	Q8N680	514 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	C5orf34	Q96MH7	638 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PPM1M	Q96MI6	270 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TTC25	Q96NG3	672 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	RNF157	Q96PX1	679 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	IL26	Q9NPH9	171 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169		A0A087X0T9	212 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169		A6NL46	340 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	FAM228B	P0C875	321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TNFRSF8	P28908	595 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	HMGCL	P35914	325 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ABR	Q12979	859 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	NFE2L1	Q14494	772 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PCSK7	Q16549	785 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	IQCK	Q8N0W5	287 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	RANBP9	Q96S59	729 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TCF4-238	ENST00000568169	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	F8	P00451	2351 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	OR6C74	A6NCV1	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	UGT1A9	O60656	530 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	PROSC	O94903	275 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	LCA5L	O95447	670 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TCF4-238	ENST00000568169	UGT1A6	P19224	532 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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