RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561085.1

SEMA4B-218, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 582 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-218ENST00000561085 OR56A5P0C7T3 313 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 PGAM1P18669 254 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 ALDH4A1P30038 563 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 SLC19A1P41440 591 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 HALP42357 657 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 ARL4CP56559 192 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 CLCA4Q14CN2 919 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 DUPD1Q68J44 220 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 NEPROQ6NW34 567 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 XKR5Q6UX68 686 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 NAT9Q9BTE0 207 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.58■■□□□ 1.21
SEMA4B-218ENST00000561085 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 F8W8V4 182 aa22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 NDUFS3O75489 264 aa22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 FTH1P02794 183 aa22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 OR1D5P58170 312 aa22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 CALCOCO2Q13137 446 aa22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.23e-6■■■■□ 19.4
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SEMA4B-218ENST00000561085 HIF1AQ16665 826 aa22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 MARCH9Q86YJ5 346 aa22.57■■□□□ 1.2
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SEMA4B-218ENST00000561085 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 TCF12Q99081 682 aa22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 SLC38A3Q99624 504 aa22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 RAB17Q9H0T7 212 aa22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.57■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 PFDN6O15212 129 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 TTC4O95801 387 aa22.56■■□□□ 1.2
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SEMA4B-218ENST00000561085 OGNP20774 298 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 LONRF1Q17RB8 773 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 TYSND1Q2T9J0 566 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 LRRC39Q96DD0 335 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 DEPDC7Q96QD5 511 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 WWP1Q9H0M0 922 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 COG4Q9H9E3 785 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.56■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 ELK3P41970 407 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 RPE65Q16518 533 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 C8orf74Q6P047 294 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 LRRC6Q86X45 466 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 CILP2Q8IUL8 1156 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 P2RY12Q9H244 342 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 UCK1Q9HA47 277 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 POT1Q9NUX5 634 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 TEX264Q9Y6I9 313 aa22.55■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa22.54■■□□□ 1.2
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SEMA4B-218ENST00000561085 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 RPA4Q13156 261 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 CBLBQ13191 982 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 CRYMQ14894 314 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 ISXQ2M1V0 245 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 AMZ1Q400G9 498 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 SPANXN3Q5MJ09 141 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 ZNF449Q6P9G9 518 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 ELMO1Q92556 727 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 CARD6Q9BX69 1037 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.53■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 D6RAR5 112 aa22.53■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 E7ESA3 106 aa22.53■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 CTAGE8P0CG41 777 aa22.53■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 CD1CP29017 333 aa22.53■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 GPLD1P80108 840 aa22.53■■□□□ 1.2
SEMA4B-218ENST00000561085 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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