RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558960.1

ADAMTS17-205, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

TSL 2

Gene ADAMTS17, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-205ENST00000558960 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 RPA4Q13156 261 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 CLCA4Q14CN2 919 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 RTP5Q14D33 572 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 SNF8Q96H20 258 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 TCF12Q99081 682 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 NAT9Q9BTE0 207 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 AK5Q9Y6K8 562 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.59■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 SPEGQ15772 3267 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 LILRA5A6NI73 299 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP1O94782 785 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 PROS1P07225 676 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 C1QTNF9P0C862 333 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCKBRP32239 447 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 RPE65Q16518 533 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 CES3Q6UWW8 571 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 USP53Q70EK8 1073 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM135Q86UB9 458 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 LRRC6Q86X45 466 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 PDIK1LQ8N165 341 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 GPR150Q8NGU9 434 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM159Q96B96 161 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZMYND15Q9H091 742 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 CDC23Q9UJX2 597 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.58■□□□□ 0.89
ADAMTS17-205ENST00000558960 BPTFQ12830 3046 aa20.58■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 NDUFS1P28331 727 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 CD151P48509 253 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 TUBB2AQ13885 445 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 KRT33BQ14525 404 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 TMEM71Q6P5X7 295 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 NAT14Q8WUY8 206 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 CARD6Q9BX69 1037 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 WWP1Q9H0M0 922 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 COG4Q9H9E3 785 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 DKK4Q9UBT3 224 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.57■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR1I1O60431 355 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 TTC4O95801 387 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 AMD1P17707 334 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 LSSP48449 732 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 SEMA3AQ14563 771 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 NEPROQ6NW34 567 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 CALML6Q8TD86 181 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 ELMO1Q92556 727 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 ZNF592Q92610 1267 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 C12orf66Q96MD2 445 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 PANX3Q96QZ0 392 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 ERP44Q9BS26 406 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.56■□□□□ 0.88
ADAMTS17-205ENST00000558960 RDH14Q9HBH5 336 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms