RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558131.1

RPL28-205, Transcript of ribosomal protein L28, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RPL28, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28-205ENST00000558131 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 OR5K3A6NET4 321 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 HACD1B0YJ81 288 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 PRAMEF1O95521 474 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 AGTP01019 485 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 PDGFAP04085 211 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 EBLN1P0CF75 366 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 RBL1P28749 1068 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 XIAPP98170 497 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 TUBB3Q13509 450 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 ITGA9Q13797 1035 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 ERV3-1Q14264 604 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 IGFBP7Q16270 282 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 ODF2Q5BJF6 829 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 PID1Q7Z2X4 250 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 UBXN4Q92575 508 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 LHX9Q9NQ69 397 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 RSPH14Q9UHP6 348 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa15.97■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 APOC2P02655 101 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 TPM1P09493 284 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 XRCC4Q13426 336 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 DNASE1L3Q13609 305 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 BCL7AQ4VC05 210 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 FNBP1LQ5T0N5 605 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 RANBP10Q6VN20 620 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 DET1Q7L5Y6 550 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 D2HGDHQ8N465 521 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 RNF214Q8ND24 703 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 OR2L2Q8NH16 312 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 RMDN2Q96LZ7 410 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 PPM1MQ96MI6 270 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 TTC25Q96NG3 672 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 FICDQ9BVA6 458 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 HEMGNQ9BXL5 484 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 WWP1Q9H0M0 922 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 FKBPLQ9UIM3 349 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 TRHDEQ9UKU6 1024 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 PKP3Q9Y446 797 aa15.96■□□□□ 0.15
RPL28-205ENST00000558131 LRRK2Q5S007 2527 aa15.96■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa15.96■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 RCCD1A6NED2 376 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 TLCD2A6NGC4 264 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 CREG1O75629 220 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 MAGEA1P43355 309 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 PMS2P54278 862 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 DAAM2Q86T65 1068 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 RCOR2Q8IZ40 523 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 SLC38A9Q8NBW4 561 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 OR4K2Q8NGD2 314 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 ZNF398Q8TD17 642 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 FCRL4Q96PJ5 515 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 FSD1LQ9BXM9 530 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 ACTL8Q9H568 366 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 KCND3Q9UK17 655 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 POLHQ9Y253 713 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa15.95■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 MGAT4DA6NG13 374 aa15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 C21orf140B9A014 251 aa15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 STX7O15400 261 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 PJA2O43164 708 aa15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 DNAJB5O75953 348 aa15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 RECKO95980 971 aa15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 PSMB4P28070 264 aa15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 AKT1P31749 480 aa15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 RPS18P62269 152 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 IL10RAQ13651 578 aa15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 PLCL1Q15111 1095 aa15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RPL28-205ENST00000558131 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms