RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	STRADB	Q9C0K7	418 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	WWP1	Q9H0M0	922 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	UCK1	Q9HA47	277 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	TREX1	Q9NSU2	369 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	OGFR	Q9NZT2	677 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	ADAMTS20	P59510	1910 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PLD2	O14939	933 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	ZW10	O43264	779 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	DUX1	O43812	170 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	TNFSF15	O95150	251 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	THRA	P10827	490 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	CCL4	P13236	92 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	TYRP1	P17643	537 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	ITIH1	P19827	911 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PTGIR	P43119	386 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	EPHA4	P54764	986 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PRAME	P78395	509 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR18	Q14330	331 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	OR4L1	Q8NH43	312 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	HM13	Q8TCT9	377 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	NCSTN	Q92542	709 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	FGF11	Q92914	225 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	MFSD3	Q96ES6	412 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	KIFC1	Q9BW19	673 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	POT1	Q9NUX5	634 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	BFAR	Q9NZS9	450 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PISD	Q9UG56	409 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	LAMA5	O15230	3695 aa		11.01	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	SDK2	Q58EX2	2172 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	CTAGE9	A4FU28	777 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985		A8MU76	341 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	ARNT	P27540	789 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PDHA2	P29803	388 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	HAL	P42357	657 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	NSG1	P42857	185 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PREP	P48147	710 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	GFER	P55789	205 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	ITIH4	Q14624	930 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PACS1	Q6VY07	963 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	LSMEM2	Q8N112	164 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	RSC1A1	Q92681	617 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	PEX13	Q92968	403 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	11	□□□□□ -0.65	7e-6	■■■■■ 27.5
TPCN1-223	ENST00000552985	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	SGSM3	Q96HU1	749 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	C12orf66	Q96MD2	445 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	COG4	Q9H9E3	785 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	KCND1	Q9NSA2	647 aa		11	□□□□□ -0.65
TPCN1-223	ENST00000552985	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65

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