RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551009.5

ATP2B1-208, Transcript of ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1, human

TSL 3

Gene ATP2B1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2B1-208	ENST00000551009	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	CPT2	P23786	658 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	MCM3	P25205	808 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	NT5C2	P49902	561 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	SLC26A5	P58743	744 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	UFM1	P61960	85 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PSMC6	P62333	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	IRF3	Q14653	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PCLAF	Q15004	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	TANK	Q92844	425 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	DNM1L	O00429	736 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	CTDSP2	O14595	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	MCF2L	O15068	1137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZBTB43	O43298	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	RTN2	O75298	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	KDM4B	O94953	1096 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	SNX4	O95219	450 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	TF	P02787	698 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	TPO	P07202	933 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	MTHFR	P42898	656 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	NRIP1	P48552	1158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	STAT2	P52630	851 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	HILS1	P60008	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	OLR1	P78380	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	COX10	Q12887	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PTK6	Q13882	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	NODAL	Q96S42	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	KRT23	Q9C075	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	ANO10	Q9NW15	660 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2B1-208	ENST00000551009	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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