RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SLCO2B1O94956 709 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 KLHL2O95198 593 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SLC34A2O95436 690 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 C2P06681 752 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SYPP08247 313 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 RBP1P09455 135 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PRSS56P0CW18 603 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 MPC1LP0DKB6 136 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CTSEP14091 401 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 KRT4P19013 534 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SAT1P21673 171 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 IDSP22304 550 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CRHR1P34998 444 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CLCN7P51798 805 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 HK3P52790 923 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CLDN2P57739 230 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 NXPH1P58417 271 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TAS2R39P59534 338 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SLC18A2Q05940 514 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ELOCQ15369 112 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CCDC153Q494R4 210 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PYCR3Q53H96 274 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 DOK6Q6PKX4 331 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PELI3Q8N2H9 469 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 OR13H1Q8NG92 308 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 MAGEC3Q8TD91 643 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 MZB1Q8WU39 189 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ELMO1Q92556 727 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SLC6A18Q96N87 628 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 NDNQ99608 321 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 GPR21Q99679 349 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 MYOCQ99972 504 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 DERL2Q9GZP9 239 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SPASTQ9UBP0 616 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CACNA1EQ15878 2313 aa9.16□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 NEMP2A6NFY4 417 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TMEM202A6NGA9 273 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 OR5K4A6NMS3 321 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SYCE1LA8MT33 242 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 GPR39O43194 453 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 NIPSNAP2O75323 286 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 MTX2O75431 263 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 GPC4O75487 556 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 RFPL1O75677 317 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PIAS1O75925 651 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SASH3O75995 380 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ZWINTO95229 277 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CSF2P04141 144 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 C8GP07360 202 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CCNFP41002 786 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 HALP42357 657 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 GNPDA1P46926 289 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CSRP3P50461 194 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CTSCP53634 463 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CDKN2DP55273 166 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 NAA20P61599 178 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SP140Q13342 867 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 BMPR2Q13873 1038 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 FZD2Q14332 565 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ACAP2Q15057 778 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 METRNLQ641Q3 311 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TTC23LQ6PF05 361 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 DET1Q7L5Y6 550 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 TRIM74Q86UV6 250 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 GKN2Q86XP6 184 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 HID1Q8IV36 788 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 HOMEZQ8IX15 550 aa9.15□□□□□ -0.94
CS-220ENST00000550700 SLC22A15Q8IZD6 547 aa9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms