RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548971.5

TARBP2-209, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, humanhuman

TSL 5

Gene TARBP2, Length 1,493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP2-209ENST00000548971 MSH3P20585 1137 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 NSG1P42857 185 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 GRK6P43250 576 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 GRTP1Q5TC63 336 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 HDXQ7Z353 690 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 TDRPQ86YL5 185 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 FAM136AQ96C01 138 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 GPR22Q99680 433 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 SLC30A3Q99726 388 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 GULP1Q9UBP9 304 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 TBK1Q9UHD2 729 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 TLDC2A0PJX2 215 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 CHUKO15111 745 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 MROH9Q5TGP6 573 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 PIM3Q86V86 326 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 CEP97Q8IW35 865 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 SLC25A45Q8N413 288 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 CLPBQ9H078 707 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 RASGRF2O14827 1237 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 GIPC1O14908 333 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 NUAK1O60285 661 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 CDK14O94921 469 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ITGB6P18564 788 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 CSRP3P50461 194 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ZNF460Q14592 562 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 CEP85LQ5SZL2 805 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 GPATCH11Q8N954 259 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ST14Q9Y5Y6 855 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 NEMP2A6NFY4 417 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 TNFRSF10CO14798 259 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 TM4SF5O14894 197 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 VEGFDO43915 354 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ESR1P03372 595 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ALPPL2P10696 532 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 PRLHRP49683 370 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 TAS2R39P59534 338 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 RASA2Q15283 850 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 TMED2Q15363 201 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ELOCQ15369 112 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 KRT71Q3SY84 523 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 CCDC157Q569K6 752 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 CCDC77Q9BR77 488 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 SLC23A2Q9UGH3 650 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP2-209ENST00000548971 KNL1Q8NG31 2342 aa20.08■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 TRIM49D1C9J1S8 452 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 IVLP07476 585 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 FDXRP22570 491 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 BCL7AQ4VC05 210 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 PIP4P1Q86T03 277 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 TTC1Q99614 292 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.07■□□□□ 0.8
TARBP2-209ENST00000548971 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms