RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 NIPSNAP2O75323 286 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ACP5P13686 325 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 STMN1P16949 149 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 BNC1Q01954 994 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 MROH9Q5TGP6 573 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 GKN2Q86XP6 184 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 DCLK2Q8N568 766 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 OR2W6PQ8NHA6 318 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 GPBAR1Q8TDU6 330 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 TMEM159Q96B96 161 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ZIM3Q96PE6 472 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 NDNQ99608 321 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 KLC4Q9NSK0 619 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 SLC39A10Q9ULF5 831 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa25.25■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 TMEM131Q92545 1883 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 TLDC2A0PJX2 215 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 DYNC1I1O14576 645 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 F7P08709 466 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 CBSLP0DN79 551 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 IDSP22304 550 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 AOAHP28039 575 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 CRABP2P29373 138 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 CBSP35520 551 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ABCG1P45844 678 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 CTBSQ01459 385 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 HLA-BQ31612 363 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 SYTL3Q4VX76 610 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 KRT222Q8N1A0 295 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD7Q92527 254 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 GPR21Q99679 349 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 TMEM168Q9H0V1 697 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 DPEP2Q9H4A9 486 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 FAM86C1Q9NVL1 165 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 KLF15Q9UIH9 416 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 PRKAB1Q9Y478 270 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 GPR179Q6PRD1 2367 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 PCDH15Q96QU1 1955 aa25.24■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 A0A1B0GTQ1 180 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 NEMP2A6NFY4 417 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 IQCF5A8MTL0 148 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 PATE3B3GLJ2 98 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 RGS4P49798 205 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 SERPINB8P50452 374 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 CLCN7P51798 805 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 RAB10P61026 200 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 IRX4P78413 519 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 KRT71Q3SY84 523 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ZNF542PQ5EBM4 170 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 PRRT3Q5FWE3 981 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 LVRNQ6Q4G3 990 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 TIFABQ6ZNK6 161 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 CFAP206Q8IYR0 622 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ZBTB2Q8N680 514 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ISL2Q96A47 359 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 CABS1Q96KC9 395 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 GAREM1Q9H706 876 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 COG4Q9H9E3 785 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 LGALS13Q9UHV8 139 aa25.23■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 GOLGA6L10A6NI86 522 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 TRIM49D1C9J1S8 452 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 AQP9O43315 295 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 PIAS2O75928 621 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 SLC2A4P14672 509 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ITGB6P18564 788 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 SAT1P21673 171 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 DGKAP23743 735 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 TYK2P29597 1187 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ATP5DP30049 168 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 CCR7P32248 378 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 SLCO1A2P46721 670 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 CCT8P50990 548 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 TAS2R39P59534 338 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 CEP85LQ5SZL2 805 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 METRNLQ641Q3 311 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 WASH2PQ6VEQ5 465 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 LRRC61Q9BV99 259 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 WASH6PQ9NQA3 447 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 EURLQ9NYK6 297 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 SLC23A2Q9UGH3 650 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 DOLKQ9UPQ8 538 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 MED16Q9Y2X0 877 aa25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 SLC5A10A0PJK1 596 aa25.21■■□□□ 1.63
STIP1-208ENST00000540501 SMIM23A6NLE4 172 aa25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms