RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL10RBQ08334 325 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADCY2Q08462 1091 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFAF2Q8N183 169 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2Y1Q8NGV0 311 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJB8Q8NHS0 232 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPOCK2Q92563 424 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM81BQ96LP2 452 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD180Q99467 661 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF559Q9BR84 538 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPAMQ9HCL2 828 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC23Q9UJX2 597 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FZD10Q9ULW2 581 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FHOD1Q9Y613 1164 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.9□□□□□ -0.82
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0J9YYE9 177 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 E7EQ34 232 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KMOO15229 486 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNHIT1O43257 154 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F13A1P00488 732 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRBC1P01850 177 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMEP08473 750 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPN9P43378 593 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMAN1P49257 510 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAM8P78325 824 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DSG2Q14126 1118 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.831e-17■■□□□ 12.3
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.89□□□□□ -0.83
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPWQ8N729 165 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LHPPQ9H008 270 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEMO1Q9Y316 297 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC16AO15027 2179 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.89□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCP110O43303 1012 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLCO2B1O94956 709 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZWINTO95229 277 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT3P12035 628 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF30P17039 623 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPD1P21695 349 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BPIFB4P59827 614 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMP22Q01453 160 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOLH1Q04609 750 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITKQ08881 620 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MFAP5Q13361 173 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STIM1Q13586 685 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALNT3Q14435 633 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPE65Q16518 533 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COBLL1Q53SF7 1204 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GBP6Q6ZN66 633 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGED4Q96JG8 741 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C17orf62Q9BQA9 187 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.88□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DOCK10Q96BY6 2186 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DYTNA2CJ06 578 aa9.87□□□□□ -0.83
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM227AF5H4B4 570 aa9.87□□□□□ -0.83
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