RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM47Q9BQJ4 181 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 REEP2Q9BRK0 252 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCGF1Q9BSM1 259 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FUCA2Q9BTY2 467 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF700Q9H0M5 742 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIGMQ9H3S5 423 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC28A3Q9HAS3 691 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFRSF19Q9NS68 423 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC6A13Q9NSD5 602 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ABI3Q9P2A4 366 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COPG2Q9UBF2 871 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RIPK3Q9Y572 518 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLIC4Q9Y696 253 aa0.68□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2M5A3KFT3 312 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF840PA6NDX5 716 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NXPH2O95156 264 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BMP10O95393 424 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PARNO95453 639 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ICAM1P05362 532 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL7RP16871 459 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF32P17041 273 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CKMT2P17540 419 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HRH2P25021 359 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXC9P31274 260 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDAP32320 146 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCR5P51681 352 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LYZP61626 148 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PICALMQ13492 652 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAF5Q15542 800 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MOGAT2Q3SYC2 334 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HIGD2BQ4VC39 106 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC38Q502W7 563 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR45BQ5MNZ6 344 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYCP2LQ5T4T6 812 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC181Q5TID7 509 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC22A25Q6T423 547 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTN2A1Q7KYR7 527 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CATSPERDQ86XM0 798 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2CD5Q86YS7 1000 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RAB42Q8N4Z0 105 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC5A8Q8N695 610 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 L3MBTL4Q8NA19 623 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RDM1Q8NG50 284 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR1J2Q8NGS2 313 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHPT1Q8WUD6 406 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMPDL3BQ92485 455 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HSD17B8Q92506 261 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DYRK2Q92630 601 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EGLN2Q96KS0 407 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP28Q96RU2 1077 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KAT14Q9H8E8 782 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PANK3Q9H999 370 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARNT2Q9HBZ2 717 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPHK2Q9NRA0 654 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ECHDC1Q9NTX5 307 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTSZQ9UBR2 303 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXL17Q9UF56 701 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR14J1Q9UGF5 321 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SUFUQ9UMX1 484 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR37Q9Y2I8 494 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRCH1Q9Y2L9 728 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMCN1Q96RW7 5635 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HCFC1P51610 2035 aa0.67□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PR80 420 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C15orf61A6NNL5 157 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP2A1O14983 1001 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BUD23O43709 281 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF217O75362 1048 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HOXB5P09067 269 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SETSIPP0DME0 302 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PIK3CAP42336 1068 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNAQP50148 359 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLCN4P51793 760 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HUNKP57058 714 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GSDMDP57764 484 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UFM1P61960 85 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C3AR1Q16581 482 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF805Q5CZA5 627 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FHL5Q5TD97 284 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC174Q6PII3 467 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CORO6Q6QEF8 472 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VITQ6UXI7 678 aa0.66□□□□□ -2.3
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa0.66□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms