RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516697.1

RNU6-180P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 180, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-180P, Length 61 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-180P-201ENST00000516697 DHODHQ02127 395 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GCNT1Q02742 428 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TLE3Q04726 772 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LGALS3BPQ08380 585 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 DMPKQ09013 629 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NAE1Q13564 534 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TDGQ13569 410 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 UBE4AQ14139 1066 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KIR2DS5Q14953 304 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 VEPH1Q14D04 833 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TEAD2Q15562 447 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 HSPB2Q16082 182 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 Q1RN00 199 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KIAA0753Q2KHM9 967 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC5A9Q2M3M2 681 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MYLK3Q32MK0 819 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 USP41Q3LFD5 358 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GXYLT1Q4G148 440 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LINC00483Q53H64 154 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 RUNDC3AQ59EK9 446 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SGO1Q5FBB7 561 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF766Q5HY98 468 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SPIN3Q5JUX0 258 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MRNIPQ6NTE8 343 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PPP4R4Q6NUP7 873 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 AADACL2Q6P093 401 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PGBD2Q6P3X8 592 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 BRAT1Q6PJG6 821 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TMEM207Q6UWW9 146 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 IL20RBQ6UXL0 311 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KSR2Q6VAB6 950 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CCDC149Q6ZUS6 474 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 BBS12Q6ZW61 710 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MTSS1LQ765P7 747 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SYT13Q7L8C5 426 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRSS45Q7RTY3 260 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OVCH2Q7RTZ1 564 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 C5orf24Q7Z6I8 188 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ISCA2Q86U28 154 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GPAT4Q86UL3 456 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PIGZQ86VD9 579 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PTOV1Q86YD1 416 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TDRPQ86YL5 185 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SFTPA2Q8IWL1 248 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TMEM61Q8N0U2 210 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 EID3Q8N140 333 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LYPD1Q8N2G4 141 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CCDC33Q8N5R6 958 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZBTB2Q8N680 514 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SYT14Q8NB59 555 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 AGBL3Q8NEM8 1001 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OR2L5Q8NG80 312 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OR6F1Q8NGZ6 308 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC35G2Q8TBE7 412 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NPRL2Q8WTW4 380 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ITLN1Q8WWA0 313 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ARNTL2Q8WYA1 636 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 APBB2Q92870 758 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MARC2Q969Z3 335 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLCO4A1Q96BD0 722 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ELSPBP1Q96BH3 223 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TADA1Q96BN2 335 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MPP4Q96JB8 637 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MAGEB18Q96M61 343 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NSMCE3Q96MG7 304 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FRG2BQ96QU4 278 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FNBP1Q96RU3 617 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MXRA8Q9BRK3 442 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PAAF1Q9BRP4 392 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms