RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NETO2Q8NC67 525 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 OR4L1Q8NH43 312 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 EDEM1Q92611 657 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ZNF566Q969W8 418 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 BIRC7Q96CA5 298 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 HSPBAP1Q96EW2 488 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SLC39A13Q96H72 371 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TRIB3Q96RU7 358 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PKMYT1Q99640 499 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CHID1Q9BWS9 393 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SIK2Q9H0K1 926 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ING2Q9H160 280 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SP110Q9HB58 689 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CATSPERZQ9NTU4 200 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 EBF1Q9UH73 591 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 FZD1Q9UP38 647 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ERVW-1Q9UQF0 538 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 GINS2Q9Y248 185 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ERGIC3Q9Y282 383 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 FIS1Q9Y3D6 152 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa9.27□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 DRGXA6NNA5 263 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CLDN25C9JDP6 229 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SLC22A1O15245 554 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PEX10O60683 326 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SULT1C4O75897 302 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ATE1O95260 518 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NDST3O95803 873 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 UGT1A6P19224 532 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 UGT1A1P22309 533 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 UGT1A4P22310 534 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 IGFBP4P22692 258 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 JAK1P23458 1154 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 RYKP34925 604 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 UGT1A3P35503 534 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 UGT1A5P35504 534 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SLC5A3P53794 718 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 RAD23AP54725 363 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CDKN2DP55273 166 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CDH15P55291 814 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 MVKQ03426 396 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SERINC3Q13530 473 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 UPP1Q16831 310 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 GPR107Q5VW38 600 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 GLYATQ6IB77 296 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 STK40Q8N2I9 435 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SETD9Q8NE22 299 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 OR9I1Q8NGQ6 314 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PTERQ96BW5 349 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 C8orf48Q96LL4 319 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 C3orf30Q96M34 536 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CCDC138Q96M89 665 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ZBTB18Q99592 522 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NACA2Q9H009 215 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 EPS8L2Q9H6S3 715 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NANOGQ9H9S0 305 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ASIC5Q9NY37 505 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NUDT4Q9NZJ9 180 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 C3orf18Q9UK00 162 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 RNF112Q9ULX5 631 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SCML2Q9UQR0 700 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ZNF711Q9Y462 761 aa9.26□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms