RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 EID3Q8N140 333 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 GBP5Q96PP8 586 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 KLC4Q9NSK0 619 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 SNX7Q9UNH6 387 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 HACD1B0YJ81 288 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 HLA-DPA1P20036 260 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PEX19P40855 299 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PRLHRP49683 370 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 MLLT10P55197 1068 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 APBA1Q02410 837 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 NIPAL4Q0D2K0 466 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PCOLCEQ15113 449 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 DCAF10Q5QP82 559 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF787Q6DD87 383 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 AMZ2Q86W34 360 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 FAR1Q8WVX9 515 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TGM7Q96PF1 710 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 AGPSO00116 658 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PEX12O00623 359 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ACP5P13686 325 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TNFAIP3P21580 790 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 SPAM1P38567 509 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 DPYSL3Q14195 570 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 GPATCH11Q8N954 259 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 HAS2Q92819 552 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 INPP5DQ92835 1189 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PHF12Q96QT6 1004 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 RANBP9Q96S59 729 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 C2orf74A8MZ97 194 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 E7EQ34 232 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 USP1O94782 785 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 CLDN7O95471 211 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 MMP11P24347 488 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 FOLR3P41439 243 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 CA7P43166 264 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 MPP3Q13368 585 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 IHHQ14623 411 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 GPR33Q49SQ1 333 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PACS1Q6VY07 963 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 CUZD1Q86UP6 607 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 GALNT16Q8N428 558 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 BCORP1Q8N888 145 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 FCRL5Q96RD9 977 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 CASS4Q9NQ75 786 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 MRFAP1Q9Y605 127 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ARGFXA6NJG6 315 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TIAF1O95411 115 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 HLA-DQB2P05538 268 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PDHA1P08559 390 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 EBLN1P0CF75 366 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 RARAP10276 462 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 XRCC4Q13426 336 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 KIR2DS3Q14952 304 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 PDK1Q15118 436 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 BBS9Q3SYG4 887 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-210ENST00000503258 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms