RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRK-215	ENST00000498284	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRK-215	ENST00000498284	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRK-215	ENST00000498284	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRK-215	ENST00000498284	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRK-215	ENST00000498284	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRK-215	ENST00000498284	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRK-215	ENST00000498284	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.21	□□□□□ -1.73
PTPRK-215	ENST00000498284	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	DVL1	O14640	695 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAM20	O43506	726 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SYNGR3	O43761	229 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	AVIL	O75366	819 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF432	O94892	652 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	NR2F1	P10589	423 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	HSD17B4	P51659	736 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	KRT33B	Q14525	404 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MCU	Q8NE86	351 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	HACL1	Q9UJ83	578 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A0G2JNG1	304 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	LMX1B	O60663	402 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PDE9A	O76083	593 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TFAP2A	P05549	437 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ADRB2	P07550	413 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	KRT19	P08727	400 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CSF2RA	P15509	400 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MCC	P23508	829 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MARK3	P27448	753 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	EPYC	Q99645	322 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1W2PPE2	198 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1W2PR64	198 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284		A6NL46	340 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRK-215	ENST00000498284	FGF17	O60258	216 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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