RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268		J3QR06	171 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	IGHV4-59	P01825	116 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	NFKBIA	P25963	317 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	COX10	Q12887	443 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	UBE2V1	Q13404	147 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	GORAB	Q5T7V8	394 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	DCLK2	Q8N568	766 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	OR8K5	Q8NH50	307 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ST8SIA4	Q92187	359 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	STRA6	Q9BX79	667 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	RNF186	Q9NXI6	227 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	C15orf62	A8K5M9	175 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	DNM1L	O00429	736 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TAS2R40	P59535	323 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	GRAP	Q13588	217 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ZNF534	Q76KX8	674 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CCDC190	Q86UF4	302 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	OR2T11	Q8NH01	316 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	GCC1	Q96CN9	775 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	SCLT1	Q96NL6	688 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		3.04	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PRG0	241 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ZBTB43	O43298	467 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	ACP2	P11117	423 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	UBL4A	P11441	157 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CAPN2	P17655	700 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PERP	Q96FX8	193 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	WDFY2	Q96P53	400 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		3.03	□□□□□ -1.92
USP34-222	ENST00000498268	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	CLDN1	O95832	211 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	HSD3B1	P14060	373 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	PBX3	P40426	434 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	OLR1	P78380	273 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	LGALS3BP	Q08380	585 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	RIG	Q13278	110 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	BIRC3	Q13489	604 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	DCAF10	Q5QP82	559 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268		Q8N377	158 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	MAGED4	Q96JG8	741 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		3.02	□□□□□ -1.93
USP34-222	ENST00000498268	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93

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