RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 ITGB6P18564 788 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CA4P22748 312 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 MAPK9P45984 424 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 GPR3P46089 330 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CTSCP53634 463 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 DRG2P55039 364 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 GFERP55789 205 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 TMPRSS3P57727 454 aa7.2□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 HHEXQ03014 270 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 BIRC2Q13490 618 aa7.2□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 SPA17Q15506 151 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC1A5Q15758 541 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF569Q5MCW4 686 aa7.2□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 XKR5Q6UX68 686 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.2□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 DTX1Q86Y01 620 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 TMTC1Q8IUR5 882 aa7.2□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC57Q8N9N7 239 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 SPC24Q8NBT2 197 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 ACTL9Q8TC94 416 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 NUDT8Q8WV74 236 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 PANX2Q96RD6 677 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 NRTNQ99748 197 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CMKLR1Q99788 373 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 DESI2Q9BSY9 194 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 FICDQ9BVA6 458 aa7.2□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 CDH19Q9H159 772 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CLMPQ9H6B4 373 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 VPS18Q9P253 973 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CPNE7Q9UBL6 633 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.2□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 ARL5AQ9Y689 179 aa7.2□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.19□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 WISP1O95388 367 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 FTCDO95954 541 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 APOC2P02655 101 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 PYGLP06737 847 aa7.19□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 F3P13726 295 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 TPH1P17752 444 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CTNNA2P26232 953 aa7.19□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 ADRA1AP35348 466 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 FASLGP48023 281 aa7.19□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 ATP1A2P50993 1020 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CLCNKAP51800 687 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 DCDC1P59894 354 aa7.19□□□□□ -1.26
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PRPF4B-208ENST00000490653 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 TMPRSS15P98073 1019 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC14A2Q15849 920 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 PPP2R5EQ16537 467 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKS6Q68DC2 871 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.19□□□□□ -1.26
PRPF4B-208ENST00000490653 RANBP10Q6VN20 620 aa7.19□□□□□ -1.26
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